Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms