Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 YGR242WYGR242W 309 nt2.6□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.6□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt2.6□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 ECM9YKR004C 1134 nt2.6□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 NYV1YLR093C 762 nt2.6□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 YNL235CYNL235C 432 nt2.6□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 YOR152CYOR152C 771 nt2.6□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 BNR1YIL159W 4128 nt2.6□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 TRZ1YKR079C 2517 nt2.6□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 MES1YGR264C 2256 nt2.59□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 UBP16YPL072W 1500 nt2.59□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 YKU80YMR106C 1890 nt2.59□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 AIM18YHR198C 966 nt2.59□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 RPS1AYLR441C 768 nt2.59□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 COQ10YOL008W 624 nt2.59□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 YOR055WYOR055W 435 nt2.59□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 ACM1YPL267W 630 nt2.59□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 VID24YBR105C 1089 nt2.59□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 DAL5YJR152W 1632 nt2.59□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 YRR1YOR162C 2433 nt2.59□□□□□ -2
VPS54Q12071 MMS1YPR164W 4224 nt2.59□□□□□ -2
VPS54Q12071 CTF13YMR094W 1437 nt2.59□□□□□ -2
VPS54Q12071 SIP3YNL257C 3690 nt2.58□□□□□ -2
VPS54Q12071 SMY2YBR172C 2223 nt2.58□□□□□ -2
VPS54Q12071 RPN3YER021W 1572 nt2.58□□□□□ -2
VPS54Q12071 ADK1YDR226W 669 nt2.58□□□□□ -2
VPS54Q12071 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt2.58□□□□□ -2
VPS54Q12071 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.58□□□□□ -2
VPS54Q12071 PAU23YLR037C 375 nt2.58□□□□□ -2
VPS54Q12071 RPS29AYLR388W 171 nt2.58□□□□□ -2
VPS54Q12071 FPR1YNL135C 345 nt2.58□□□□□ -2
VPS54Q12071 YOL029CYOL029C 606 nt2.58□□□□□ -2
VPS54Q12071 YOR169CYOR169C 465 nt2.58□□□□□ -2
VPS54Q12071 FAR11YNL127W 2862 nt2.58□□□□□ -2
VPS54Q12071 PUF4YGL014W 2667 nt2.57□□□□□ -2
VPS54Q12071 SWR1YDR334W 4545 nt2.57□□□□□ -2
VPS54Q12071 YKR078WYKR078W 1758 nt2.57□□□□□ -2
VPS54Q12071 TMA20YER007C-A 546 nt2.57□□□□□ -2
VPS54Q12071 TDA2YER071C 381 nt2.57□□□□□ -2
VPS54Q12071 OTU2YHL013C 924 nt2.57□□□□□ -2
VPS54Q12071 FYV4YHR059W 393 nt2.57□□□□□ -2
VPS54Q12071 ACF4YJR083C 930 nt2.57□□□□□ -2
VPS54Q12071 SRP21YKL122C 504 nt2.57□□□□□ -2
VPS54Q12071 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.57□□□□□ -2
VPS54Q12071 DNL4YOR005C 2835 nt2.57□□□□□ -2
VPS54Q12071 SGM1YJR134C 2124 nt2.57□□□□□ -2
VPS54Q12071 RGA2YDR379W 3030 nt2.57□□□□□ -2
VPS54Q12071 SDC25YLL016W 3147 nt2.57□□□□□ -2
VPS54Q12071 KEL2YGR238C 2649 nt2.56□□□□□ -2
VPS54Q12071 VPS41YDR080W 2979 nt2.56□□□□□ -2
VPS54Q12071 KRE33YNL132W 3171 nt2.56□□□□□ -2
VPS54Q12071 PSD2YGR170W 3417 nt2.56□□□□□ -2
VPS54Q12071 SHE4YOR035C 2370 nt2.56□□□□□ -2
VPS54Q12071 snR59snR59 78 nt2.56□□□□□ -2
VPS54Q12071 snR76snR76 109 nt2.56□□□□□ -2
VPS54Q12071 YDR042CYDR042C 603 nt2.56□□□□□ -2
VPS54Q12071 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt2.56□□□□□ -2
VPS54Q12071 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt2.56□□□□□ -2
VPS54Q12071 YAP7YOL028C 738 nt2.56□□□□□ -2
VPS54Q12071 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.56□□□□□ -2
VPS54Q12071 REF2YDR195W 1602 nt2.56□□□□□ -2
VPS54Q12071 ORC2YBR060C 1863 nt2.56□□□□□ -2
VPS54Q12071 YDR115WYDR115W 318 nt2.55□□□□□ -2
VPS54Q12071 SNO3YFL060C 669 nt2.55□□□□□ -2
VPS54Q12071 NEL1YHR035W 1893 nt2.55□□□□□ -2
VPS54Q12071 YHR054CYHR054C 1065 nt2.55□□□□□ -2
VPS54Q12071 AIM19YIL087C 474 nt2.55□□□□□ -2
VPS54Q12071 PRP21YJL203W 843 nt2.55□□□□□ -2
VPS54Q12071 SNO2YNL334C 669 nt2.55□□□□□ -2
VPS54Q12071 ARL3YPL051W 597 nt2.55□□□□□ -2
VPS54Q12071 YIL080WYIL080W 4722 nt2.55□□□□□ -2
VPS54Q12071 NAB6YML117W 3405 nt2.55□□□□□ -2
VPS54Q12071 SIR3YLR442C 2937 nt2.55□□□□□ -2
VPS54Q12071 ARP8YOR141C 2646 nt2.55□□□□□ -2
VPS54Q12071 TOR1YJR066W 7413 nt2.54□□□□□ -2
VPS54Q12071 HYP2YEL034W 474 nt2.54□□□□□ -2
VPS54Q12071 YER189WYER189W 369 nt2.54□□□□□ -2
VPS54Q12071 YGR226CYGR226C 210 nt2.54□□□□□ -2
VPS54Q12071 YAP5YIR018W 738 nt2.54□□□□□ -2
VPS54Q12071 YLR224WYLR224W 1110 nt2.54□□□□□ -2
VPS54Q12071 RGM1YMR182C 636 nt2.54□□□□□ -2
VPS54Q12071 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.54□□□□□ -2
VPS54Q12071 ESF2YNR054C 951 nt2.54□□□□□ -2
VPS54Q12071 snR189snR189 189 nt2.54□□□□□ -2
VPS54Q12071 PHO91YNR013C 2685 nt2.54□□□□□ -2
VPS54Q12071 NPR1YNL183C 2373 nt2.53□□□□□ -2
VPS54Q12071 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.53□□□□□ -2
VPS54Q12071 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.53□□□□□ -2
VPS54Q12071 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.53□□□□□ -2
VPS54Q12071 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.53□□□□□ -2
VPS54Q12071 YER138CYER138C 5268 nt2.53□□□□□ -2
VPS54Q12071 YER160CYER160C 5268 nt2.53□□□□□ -2
VPS54Q12071 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.53□□□□□ -2
VPS54Q12071 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.53□□□□□ -2
VPS54Q12071 YJR027WYJR027W 5268 nt2.53□□□□□ -2
VPS54Q12071 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.53□□□□□ -2
VPS54Q12071 YML039WYML039W 5268 nt2.53□□□□□ -2
VPS54Q12071 YML045WYML045W 5268 nt2.53□□□□□ -2
VPS54Q12071 YMR050CYMR050C 5268 nt2.53□□□□□ -2
VPS54Q12071 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.53□□□□□ -2
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