Protein–RNA interactions for Protein: Q04599

MRPL1, 54S ribosomal protein L1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 285 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPL1	Q04599	TCD1	YHR003C	1290 nt		3	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	RPA12	YJR063W	378 nt		3	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	TEN1	YLR010C	483 nt		3	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	YBL039W-B	YBL039W-B	180 nt		3	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	RRT16	YNL105W	429 nt		3	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	PDR17	YNL264C	1053 nt		3	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	VID24	YBR105C	1089 nt		3	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	SYO1	YDL063C	1863 nt		3	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	MPS1	YDL028C	2295 nt		3	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	STU2	YLR045C	2667 nt		3	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	BEM4	YPL161C	1902 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	KAR9	YPL269W	1935 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	VAC8	YEL013W	1737 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	NOP4	YPL043W	2058 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	MUS81	YDR386W	1899 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	EAP1	YKL204W	1899 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	CDC50	YCR094W	1176 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	YDL240C-A	YDL240C-A	138 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	PAU10	YDR542W	363 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	PAU11	YGL261C	363 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	SOD1	YJR104C	465 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	YAL037W	YAL037W	804 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	PAU4	YLR461W	363 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	YNL146C-A	YNL146C-A	195 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	YBR032W	YBR032W	303 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	RIM13	YMR154C	2184 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	EPL1	YFL024C	2499 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	IRC3	YDR332W	2070 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	MED1	YPR070W	1701 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	SHQ1	YIL104C	1524 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	RTT105	YER104W	627 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	SMX2	YFL017W-A	234 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	YAR053W	YAR053W	297 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	YMR122W-A	YMR122W-A	255 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	NOP15	YNL110C	663 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	YOR192C-C	YOR192C-C	237 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	YOR231C-A	YOR231C-A	201 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	NTC20	YBR188C	423 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	POL4	YCR014C	1749 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	HOP1	YIL072W	1818 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	AUS1	YOR011W	4185 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	PKH1	YDR490C	2301 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	PRP22	YER013W	3438 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	DNM1	YLL001W	2274 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	YDR366C	YDR366C	399 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	YER066C-A	YER066C-A	501 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	YER091C-A	YER091C-A	222 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	YGR053C	YGR053C	852 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	NBL1	YHR199C-A	222 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	MRPL31	YKL138C	396 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	ARV1	YLR242C	966 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	COX8	YLR395C	237 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	UBC7	YMR022W	498 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	YAF9	YNL107W	681 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	YOL114C	YOL114C	609 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	YLR352W	YLR352W	2424 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	RIX1	YHR197W	2292 nt		2.96	□□□□□ -1.93
MRPL1	Q04599	MAL33	YBR297W	1407 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	GIS4	YML006C	2325 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	PCK1	YKR097W	1650 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	YCR090C	YCR090C	549 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	YDR442W	YDR442W	393 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	YER137W-A	YER137W-A	306 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	tK(UUU)D	tK(UUU)D	73 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	tK(UUU)G1	tK(UUU)G1	73 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	tK(UUU)G2	tK(UUU)G2	73 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	tK(UUU)K	tK(UUU)K	73 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	tK(UUU)L	tK(UUU)L	73 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	tK(UUU)O	tK(UUU)O	73 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	tK(UUU)P	tK(UUU)P	73 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	RPB9	YGL070C	369 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	FYV4	YHR059W	393 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	DFG10	YIL049W	762 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	ILV5	YLR355C	1188 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	YML009C-A	YML009C-A	327 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	YPR016W-A	YPR016W-A	261 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	LTP1	YPR073C	486 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	GPI17	YDR434W	1605 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	MUB1	YMR100W	1863 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	PUF6	YDR496C	1971 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	YGR242W	YGR242W	309 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	YMR158W-B	YMR158W-B	321 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	GOT1	YMR292W	417 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	GIS2	YNL255C	462 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	COQ10	YOL008W	624 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	RRD2	YPL152W	1077 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	SRP68	YPL243W	1800 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	DSE4	YNR067C	3354 nt		2.94	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	YPS6	YIR039C	1614 nt		2.94	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	REC8	YPR007C	2043 nt		2.94	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	PSF1	YDR013W	627 nt		2.94	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	CDC26	YFR036W	375 nt		2.94	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	MRPL38	YKL170W	417 nt		2.94	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	YKL100C	YKL100C	1764 nt		2.94	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	CHA4	YLR098C	1947 nt		2.93	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	YRR1	YOR162C	2433 nt		2.93	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	MET10	YFR030W	3108 nt		2.93	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	POL2	YNL262W	6669 nt		2.93	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	YCR022C	YCR022C	345 nt		2.93	□□□□□ -1.94
MRPL1	Q04599	YFL065C	YFL065C	309 nt		2.93	□□□□□ -1.94

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.3 ms