Protein–RNA interactions for Protein: P34228

SEF1, Putative transcription factor SEF1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEF1P34228 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt2.75□□□□□ -1.97
SEF1P34228 HSP10YOR020C 321 nt2.75□□□□□ -1.97
SEF1P34228 OST2YOR103C 393 nt2.75□□□□□ -1.97
SEF1P34228 RRD2YPL152W 1077 nt2.75□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YPR096CYPR096C 303 nt2.75□□□□□ -1.97
SEF1P34228 SRB8YCR081W 4284 nt2.75□□□□□ -1.97
SEF1P34228 DBP7YKR024C 2229 nt2.74□□□□□ -1.97
SEF1P34228 PRP8YHR165C 7242 nt2.74□□□□□ -1.97
SEF1P34228 MET32YDR253C 576 nt2.74□□□□□ -1.97
SEF1P34228 HPA3YEL066W 540 nt2.74□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.74□□□□□ -1.97
SEF1P34228 ERV1YGR029W 570 nt2.74□□□□□ -1.97
SEF1P34228 DFG10YIL049W 762 nt2.74□□□□□ -1.97
SEF1P34228 PAU23YLR037C 375 nt2.74□□□□□ -1.97
SEF1P34228 JID1YPR061C 906 nt2.74□□□□□ -1.97
SEF1P34228 INP52YNL106C 3552 nt2.74□□□□□ -1.97
SEF1P34228 RPL23BYER117W 414 nt2.73□□□□□ -1.97
SEF1P34228 MPO1YGL010W 525 nt2.73□□□□□ -1.97
SEF1P34228 PRM8YGL053W 714 nt2.73□□□□□ -1.97
SEF1P34228 VPS51YKR020W 495 nt2.73□□□□□ -1.97
SEF1P34228 PHO80YOL001W 882 nt2.73□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YOL150CYOL150C 312 nt2.73□□□□□ -1.97
SEF1P34228 APC2YLR127C 2562 nt2.73□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YER138CYER138C 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YER160CYER160C 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YJR027WYJR027W 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YML039WYML039W 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YML045WYML045W 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YMR050CYMR050C 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.73□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.73□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YGR290WYGR290W 444 nt2.72□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.72□□□□□ -1.97
SEF1P34228 OTU2YHL013C 924 nt2.72□□□□□ -1.97
SEF1P34228 FYV4YHR059W 393 nt2.72□□□□□ -1.97
SEF1P34228 GPI14YJR013W 1212 nt2.72□□□□□ -1.97
SEF1P34228 EAF6YJR082C 342 nt2.72□□□□□ -1.97
SEF1P34228 HRI1YLR301W 735 nt2.72□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt2.72□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YNR021WYNR021W 1215 nt2.72□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YBL108WYBL108W 306 nt2.72□□□□□ -1.97
SEF1P34228 PHR1YOR386W 1698 nt2.72□□□□□ -1.97
SEF1P34228 GDI1YER136W 1356 nt2.72□□□□□ -1.97
SEF1P34228 SSF1YHR066W 1362 nt2.72□□□□□ -1.97
SEF1P34228 BUB1YGR188C 3066 nt2.72□□□□□ -1.97
SEF1P34228 DRS2YAL026C 4068 nt2.72□□□□□ -1.97
SEF1P34228 JSN1YJR091C 3276 nt2.71□□□□□ -1.98
SEF1P34228 CWC22YGR278W 1734 nt2.71□□□□□ -1.98
SEF1P34228 SSN2YDR443C 4263 nt2.71□□□□□ -1.98
SEF1P34228 NPR3YHL023C 3441 nt2.71□□□□□ -1.98
SEF1P34228 HHT2YNL031C 411 nt2.71□□□□□ -1.98
SEF1P34228 NFT1YKR103W 3657 nt2.71□□□□□ -1.98
SEF1P34228 TRM2YKR056W 1920 nt2.71□□□□□ -1.98
SEF1P34228 FUS1YCL027W 1539 nt2.71□□□□□ -1.98
SEF1P34228 COG3YER157W 2406 nt2.71□□□□□ -1.98
SEF1P34228 SIP3YNL257C 3690 nt2.71□□□□□ -1.98
SEF1P34228 DUG2YBR281C 2637 nt2.71□□□□□ -1.98
SEF1P34228 SNF12YNR023W 1701 nt2.71□□□□□ -1.98
SEF1P34228 ROG1YGL144C 2058 nt2.7□□□□□ -1.98
SEF1P34228 BI4Q0120 1917 nt2.7□□□□□ -1.98
SEF1P34228 YDR199WYDR199W 366 nt2.7□□□□□ -1.98
SEF1P34228 YGL015CYGL015C 393 nt2.7□□□□□ -1.98
SEF1P34228 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.7□□□□□ -1.98
SEF1P34228 YIL175WYIL175W 318 nt2.7□□□□□ -1.98
SEF1P34228 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt2.7□□□□□ -1.98
SEF1P34228 AFB1YLR040C 675 nt2.7□□□□□ -1.98
SEF1P34228 YLR302CYLR302C 363 nt2.7□□□□□ -1.98
SEF1P34228 GAL7YBR018C 1101 nt2.7□□□□□ -1.98
SEF1P34228 YPL034WYPL034W 498 nt2.7□□□□□ -1.98
SEF1P34228 ALG14YBR070C 714 nt2.7□□□□□ -1.98
SEF1P34228 ARR2YPR200C 393 nt2.7□□□□□ -1.98
SEF1P34228 YPR203WYPR203W 309 nt2.7□□□□□ -1.98
SEF1P34228 UTP14YML093W 2700 nt2.7□□□□□ -1.98
SEF1P34228 YLR278CYLR278C 4026 nt2.7□□□□□ -1.98
SEF1P34228 UBP16YPL072W 1500 nt2.69□□□□□ -1.98
SEF1P34228 ORC1YML065W 2745 nt2.69□□□□□ -1.98
SEF1P34228 GPI19YDR437W 423 nt2.69□□□□□ -1.98
SEF1P34228 PNC1YGL037C 651 nt2.69□□□□□ -1.98
SEF1P34228 SPO13YHR014W 876 nt2.69□□□□□ -1.98
SEF1P34228 YKR051WYKR051W 1257 nt2.69□□□□□ -1.98
SEF1P34228 NYV1YLR093C 762 nt2.69□□□□□ -1.98
SEF1P34228 ATP19YOL077W-A 207 nt2.69□□□□□ -1.98
SEF1P34228 PEP12YOR036W 867 nt2.69□□□□□ -1.98
SEF1P34228 SSF2YDR312W 1362 nt2.69□□□□□ -1.98
SEF1P34228 TOM1YDR457W 9807 nt2.69□□□□□ -1.98
SEF1P34228 SNU56YDR240C 1479 nt2.69□□□□□ -1.98
SEF1P34228 FIR1YER032W 2631 nt2.69□□□□□ -1.98
SEF1P34228 TLC1TLC1 1301 nt2.68□□□□□ -1.98
SEF1P34228 RLF2YPR018W 1821 nt2.68□□□□□ -1.98
SEF1P34228 SPB1YCL054W 2526 nt2.68□□□□□ -1.98
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