Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms