Protein–RNA interactions for Protein: Q12501

TY2B-OR2, Transposon Ty2-OR2 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-OR2Q12501 YOL159CYOL159C 516 nt1.42□□□□□ -2.18
TY2B-OR2Q12501 PIG2YIL045W 1617 nt1.42□□□□□ -2.18
TY2B-OR2Q12501 HCS1YKL017C 2052 nt1.42□□□□□ -2.18
TY2B-OR2Q12501 NRG1YDR043C 696 nt1.42□□□□□ -2.18
TY2B-OR2Q12501 SSP2YOR242C 1116 nt1.42□□□□□ -2.18
TY2B-OR2Q12501 RGL1YPL066W 1440 nt1.41□□□□□ -2.18
TY2B-OR2Q12501 NHP2YDL208W 471 nt1.41□□□□□ -2.18
TY2B-OR2Q12501 CDA2YLR308W 939 nt1.41□□□□□ -2.18
TY2B-OR2Q12501 DSS1YMR287C 2910 nt1.4□□□□□ -2.18
TY2B-OR2Q12501 AIM14YGL160W 1713 nt1.4□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 YGR117CYGR117C 1431 nt1.4□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 SAR1YPL218W 573 nt1.4□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 YDR341CYDR341C 1824 nt1.4□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.39□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 RPF2YKR081C 1035 nt1.39□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 HTA2YBL003C 399 nt1.39□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 DIA1YMR316W 1011 nt1.39□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 YOL134CYOL134C 390 nt1.39□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 ERP4YOR016C 624 nt1.39□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 PMD1YER132C 5262 nt1.39□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 YDL163WYDL163W 303 nt1.39□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 OTU2YHL013C 924 nt1.39□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 YHL044WYHL044W 708 nt1.39□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 MGA1YGR249W 1371 nt1.39□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 AIM18YHR198C 966 nt1.38□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 YKR075CYKR075C 924 nt1.38□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 TFC8YPL007C 1767 nt1.38□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 MON2YNL297C 4911 nt1.38□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 YNL011CYNL011C 1335 nt1.38□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 MSL5YLR116W 1431 nt1.38□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 FIG2YCR089W 4830 nt1.37□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 CGR1YGL029W 363 nt1.37□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 MCM22YJR135C 720 nt1.37□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 YLR050CYLR050C 486 nt1.37□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 PEX12YMR026C 1200 nt1.37□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 TPP1YMR156C 717 nt1.37□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 URA10YMR271C 684 nt1.37□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 YNL276CYNL276C 396 nt1.37□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 TIM18YOR297C 579 nt1.37□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 PBI1YPL272C 1554 nt1.37□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 EFG1YGR271C-A 702 nt1.36□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 IME1YJR094C 1083 nt1.36□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 IGO1YNL157W 507 nt1.36□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 YCL046WYCL046W 324 nt1.36□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 SNF12YNR023W 1701 nt1.36□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 YOR019WYOR019W 2193 nt1.36□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 YFH7YFR007W 1062 nt1.36□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 YOL014WYOL014W 375 nt1.36□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 TYE7YOR344C 876 nt1.36□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 POM152YMR129W 4014 nt1.36□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 SET4YJL105W 1683 nt1.36□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 YKL100CYKL100C 1764 nt1.35□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 AIM4YBR194W 372 nt1.35□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 UTP8YGR128C 2142 nt1.34□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 ARF1YDL192W 546 nt1.34□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 HRT1YOL133W 366 nt1.34□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 NST1YNL091W 3723 nt1.34□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 TRL1YJL087C 2484 nt1.34□□□□□ -2.19
TY2B-OR2Q12501 AVT2YEL064C 1443 nt1.34□□□□□ -2.2
TY2B-OR2Q12501 RVS161YCR009C 798 nt1.34□□□□□ -2.2
TY2B-OR2Q12501 YGR283CYGR283C 1026 nt1.34□□□□□ -2.2
TY2B-OR2Q12501 YLR076CYLR076C 423 nt1.34□□□□□ -2.2
TY2B-OR2Q12501 YNL109WYNL109W 546 nt1.34□□□□□ -2.2
TY2B-OR2Q12501 COS1YNL336W 1146 nt1.34□□□□□ -2.2
TY2B-OR2Q12501 HSP10YOR020C 321 nt1.34□□□□□ -2.2
TY2B-OR2Q12501 WIP1YDR374W-A 270 nt1.33□□□□□ -2.2
TY2B-OR2Q12501 YSY6YBR162W-A 198 nt1.33□□□□□ -2.2
TY2B-OR2Q12501 YPR146CYPR146C 330 nt1.32□□□□□ -2.2
TY2B-OR2Q12501 SLY41YOR307C 1362 nt1.32□□□□□ -2.2
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TY2B-OR2Q12501 SYO1YDL063C 1863 nt1.31□□□□□ -2.2
TY2B-OR2Q12501 RKM4YDR257C 1485 nt1.3□□□□□ -2.2
TY2B-OR2Q12501 TSC13YDL015C 933 nt1.3□□□□□ -2.2
TY2B-OR2Q12501 YML009C-AYML009C-A 327 nt1.3□□□□□ -2.2
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TY2B-OR2Q12501 PEP12YOR036W 867 nt1.3□□□□□ -2.2
TY2B-OR2Q12501 YBR292CYBR292C 372 nt1.3□□□□□ -2.2
TY2B-OR2Q12501 YNL018CYNL018C 1839 nt1.29□□□□□ -2.2
TY2B-OR2Q12501 TGL2YDR058C 981 nt1.29□□□□□ -2.2
TY2B-OR2Q12501 PNT1YOR266W 1272 nt1.29□□□□□ -2.2
TY2B-OR2Q12501 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt1.29□□□□□ -2.2
TY2B-OR2Q12501 YER087C-AYER087C-A 552 nt1.29□□□□□ -2.2
TY2B-OR2Q12501 YGR011WYGR011W 327 nt1.29□□□□□ -2.2
TY2B-OR2Q12501 YBL081WYBL081W 1107 nt1.29□□□□□ -2.2
TY2B-OR2Q12501 RPS29BYDL061C 171 nt1.28□□□□□ -2.2
TY2B-OR2Q12501 YNL228WYNL228W 777 nt1.28□□□□□ -2.2
TY2B-OR2Q12501 YVC1YOR087W 2028 nt1.28□□□□□ -2.21
TY2B-OR2Q12501 CDC37YDR168W 1521 nt1.27□□□□□ -2.21
TY2B-OR2Q12501 YGL165CYGL165C 579 nt1.27□□□□□ -2.21
TY2B-OR2Q12501 NCE101YJL205C 162 nt1.27□□□□□ -2.21
TY2B-OR2Q12501 URA5YML106W 681 nt1.27□□□□□ -2.21
TY2B-OR2Q12501 LSM2YBL026W 288 nt1.27□□□□□ -2.21
TY2B-OR2Q12501 EAP1YKL204W 1899 nt1.27□□□□□ -2.21
TY2B-OR2Q12501 SFG1YOR315W 1041 nt1.26□□□□□ -2.21
TY2B-OR2Q12501 IRC4YDR540C 540 nt1.26□□□□□ -2.21
TY2B-OR2Q12501 YDR521WYDR521W 336 nt1.25□□□□□ -2.21
TY2B-OR2Q12501 SEC21YNL287W 2808 nt1.25□□□□□ -2.21
TY2B-OR2Q12501 ANR2YKL047W 1551 nt1.24□□□□□ -2.21
TY2B-OR2Q12501 BUL2YML111W 2763 nt1.24□□□□□ -2.21
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