Protein–RNA interactions for Protein: Q12089

AEP3, ATPase expression protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AEP3Q12089 REF2YDR195W 1602 nt2.54□□□□□ -2
AEP3Q12089 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.54□□□□□ -2
AEP3Q12089 snR59snR59 78 nt2.54□□□□□ -2
AEP3Q12089 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.54□□□□□ -2
AEP3Q12089 AIM18YHR198C 966 nt2.54□□□□□ -2
AEP3Q12089 ACF4YJR083C 930 nt2.54□□□□□ -2
AEP3Q12089 ECM9YKR004C 1134 nt2.54□□□□□ -2
AEP3Q12089 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.54□□□□□ -2
AEP3Q12089 ESF2YNR054C 951 nt2.54□□□□□ -2
AEP3Q12089 SRL4YPL033C 846 nt2.54□□□□□ -2
AEP3Q12089 YRR1YOR162C 2433 nt2.54□□□□□ -2
AEP3Q12089 MES1YGR264C 2256 nt2.54□□□□□ -2
AEP3Q12089 ISW1YBR245C 3390 nt2.54□□□□□ -2
AEP3Q12089 HEH2YDR458C 1992 nt2.54□□□□□ -2
AEP3Q12089 SEC7YDR170C 6030 nt2.54□□□□□ -2
AEP3Q12089 TOM1YDR457W 9807 nt2.53□□□□□ -2
AEP3Q12089 DYN1YKR054C 12279 nt2.53□□□□□ -2
AEP3Q12089 SLH1YGR271W 5904 nt2.53□□□□□ -2
AEP3Q12089 YLR001CYLR001C 2589 nt2.53□□□□□ -2
AEP3Q12089 ADK1YDR226W 669 nt2.53□□□□□ -2
AEP3Q12089 RTS3YGR161C 792 nt2.53□□□□□ -2
AEP3Q12089 YIL174WYIL174W 228 nt2.53□□□□□ -2
AEP3Q12089 SYS1YJL004C 612 nt2.53□□□□□ -2
AEP3Q12089 YJL119CYJL119C 324 nt2.53□□□□□ -2
AEP3Q12089 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.53□□□□□ -2
AEP3Q12089 SRP21YKL122C 504 nt2.53□□□□□ -2
AEP3Q12089 YMR187CYMR187C 1296 nt2.53□□□□□ -2
AEP3Q12089 YAP7YOL028C 738 nt2.53□□□□□ -2
AEP3Q12089 VID24YBR105C 1089 nt2.53□□□□□ -2
AEP3Q12089 TOP2YNL088W 4287 nt2.52□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 GYP7YDL234C 2241 nt2.52□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 YDR042CYDR042C 603 nt2.52□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 TMA20YER007C-A 546 nt2.52□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 PRP38YGR075C 729 nt2.52□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 PRP21YJL203W 843 nt2.52□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.52□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 YLR224WYLR224W 1110 nt2.52□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt2.52□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 RGM1YMR182C 636 nt2.52□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 YOL029CYOL029C 606 nt2.52□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 ISU1YPL135W 498 nt2.52□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 YBT1YLL048C 4986 nt2.52□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 SRO77YBL106C 3033 nt2.52□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 RLI1YDR091C 1827 nt2.52□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 RPA190YOR341W 4995 nt2.51□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 SHE4YOR035C 2370 nt2.51□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 snR5snR5 204 nt2.51□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 snR76snR76 109 nt2.51□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt2.51□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 RPL14BYHL001W 417 nt2.51□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 AIM19YIL087C 474 nt2.51□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 PAU23YLR037C 375 nt2.51□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 ILV5YLR355C 1188 nt2.51□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 PDP3YLR455W 915 nt2.51□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 PEP12YOR036W 867 nt2.51□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 ARL3YPL051W 597 nt2.51□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 MUD1YBR119W 897 nt2.51□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 NEL1YHR035W 1893 nt2.51□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 NPR1YNL183C 2373 nt2.51□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 NTO1YPR031W 2247 nt2.5□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 RTT10YPL183C 3042 nt2.5□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 YKU80YMR106C 1890 nt2.5□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 SDC25YLL016W 3147 nt2.5□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt2.5□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 MST27YGL051W 705 nt2.5□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 YHR054CYHR054C 1065 nt2.5□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 PEX18YHR160C 852 nt2.5□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 RPS1AYLR441C 768 nt2.5□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 RPL6AYML073C 531 nt2.5□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 RPL36AYMR194W 303 nt2.5□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 YNL150WYNL150W 408 nt2.5□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 MSB2YGR014W 3921 nt2.49□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 SMY2YBR172C 2223 nt2.49□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 TIF35YDR429C 825 nt2.49□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 YJR087WYJR087W 351 nt2.49□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 YKL123WYKL123W 381 nt2.49□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 YNR021WYNR021W 1215 nt2.49□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 TAZ1YPR140W 1146 nt2.49□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.49□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 TPS2YDR074W 2691 nt2.49□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 SAK1YER129W 3429 nt2.49□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 SNF12YNR023W 1701 nt2.48□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 IRC2YDR112W 309 nt2.48□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.48□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.48□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 RPS17BYDR447C 411 nt2.48□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 PRE1YER012W 597 nt2.48□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 YGR226CYGR226C 210 nt2.48□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 ATP18YML081C-A 180 nt2.48□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.48□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 YMR254CYMR254C 309 nt2.48□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 YNL179CYNL179C 438 nt2.48□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 YOL134CYOL134C 390 nt2.48□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 CSM4YPL200W 471 nt2.48□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 YPR147CYPR147C 915 nt2.48□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 GPI17YDR434W 1605 nt2.48□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 PSD2YGR170W 3417 nt2.47□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 YIL166CYIL166C 1629 nt2.47□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 SIR3YLR442C 2937 nt2.47□□□□□ -2.01
AEP3Q12089 snR9snR9 187 nt2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 64 ms