Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.2 ms