Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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