Protein–RNA interactions for Protein: Q12330

SME1, Small nuclear ribonucleoprotein E, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SME1Q12330 ALY1YKR021W 2748 nt2.09□□□□□ -2.07
SME1Q12330 YJL202CYJL202C 348 nt2.09□□□□□ -2.07
SME1Q12330 PET191YJR034W 327 nt2.09□□□□□ -2.07
SME1Q12330 BET3YKR068C 582 nt2.09□□□□□ -2.07
SME1Q12330 RGM1YMR182C 636 nt2.09□□□□□ -2.07
SME1Q12330 RRT16YNL105W 429 nt2.09□□□□□ -2.07
SME1Q12330 CRS5YOR031W 210 nt2.09□□□□□ -2.07
SME1Q12330 RRP15YPR143W 753 nt2.09□□□□□ -2.07
SME1Q12330 SCY1YGL083W 2415 nt2.09□□□□□ -2.08
SME1Q12330 TMA64YDR117C 1698 nt2.09□□□□□ -2.08
SME1Q12330 SIP3YNL257C 3690 nt2.09□□□□□ -2.08
SME1Q12330 MRPL32YCR003W 552 nt2.08□□□□□ -2.08
SME1Q12330 YCR090CYCR090C 549 nt2.08□□□□□ -2.08
SME1Q12330 YDR262WYDR262W 819 nt2.08□□□□□ -2.08
SME1Q12330 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.08□□□□□ -2.08
SME1Q12330 RPS30AYLR287C-A 192 nt2.08□□□□□ -2.08
SME1Q12330 ILV5YLR355C 1188 nt2.08□□□□□ -2.08
SME1Q12330 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt2.08□□□□□ -2.08
SME1Q12330 YOR055WYOR055W 435 nt2.08□□□□□ -2.08
SME1Q12330 YBR209WYBR209W 318 nt2.08□□□□□ -2.08
SME1Q12330 APA1YCL050C 966 nt2.08□□□□□ -2.08
SME1Q12330 YHR078WYHR078W 1659 nt2.08□□□□□ -2.08
SME1Q12330 YDR338CYDR338C 2088 nt2.07□□□□□ -2.08
SME1Q12330 HRD3YLR207W 2502 nt2.07□□□□□ -2.08
SME1Q12330 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.07□□□□□ -2.08
SME1Q12330 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.07□□□□□ -2.08
SME1Q12330 PAU10YDR542W 363 nt2.07□□□□□ -2.08
SME1Q12330 PAU11YGL261C 363 nt2.07□□□□□ -2.08
SME1Q12330 CKA1YIL035C 1119 nt2.07□□□□□ -2.08
SME1Q12330 RFA3YJL173C 369 nt2.07□□□□□ -2.08
SME1Q12330 NEJ1YLR265C 1029 nt2.07□□□□□ -2.08
SME1Q12330 PAU4YLR461W 363 nt2.07□□□□□ -2.08
SME1Q12330 RIM9YMR063W 720 nt2.07□□□□□ -2.08
SME1Q12330 MSB2YGR014W 3921 nt2.07□□□□□ -2.08
SME1Q12330 ESC2YDR363W 1371 nt2.07□□□□□ -2.08
SME1Q12330 GPI17YDR434W 1605 nt2.06□□□□□ -2.08
SME1Q12330 PSK2YOL045W 3306 nt2.06□□□□□ -2.08
SME1Q12330 ROY1YMR258C 1662 nt2.06□□□□□ -2.08
SME1Q12330 INP51YIL002C 2841 nt2.06□□□□□ -2.08
SME1Q12330 SSP1YHR184W 1716 nt2.06□□□□□ -2.08
SME1Q12330 YRB1YDR002W 606 nt2.06□□□□□ -2.08
SME1Q12330 GPI19YDR437W 423 nt2.06□□□□□ -2.08
SME1Q12330 TIM9YEL020W-A 264 nt2.06□□□□□ -2.08
SME1Q12330 YKR070WYKR070W 1059 nt2.06□□□□□ -2.08
SME1Q12330 ATP3YBR039W 936 nt2.06□□□□□ -2.08
SME1Q12330 CUR1YPR158W 759 nt2.06□□□□□ -2.08
SME1Q12330 DAD3YBR233W-A 285 nt2.06□□□□□ -2.08
SME1Q12330 SLS1YLR139C 1932 nt2.06□□□□□ -2.08
SME1Q12330 HSC82YMR186W 2118 nt2.06□□□□□ -2.08
SME1Q12330 AYT1YLL063C 1425 nt2.06□□□□□ -2.08
SME1Q12330 UBP16YPL072W 1500 nt2.06□□□□□ -2.08
SME1Q12330 SNX41YDR425W 1878 nt2.05□□□□□ -2.08
SME1Q12330 SAK1YER129W 3429 nt2.05□□□□□ -2.08
SME1Q12330 TRZ1YKR079C 2517 nt2.05□□□□□ -2.08
SME1Q12330 ADK1YDR226W 669 nt2.05□□□□□ -2.08
SME1Q12330 GLC7YER133W 939 nt2.05□□□□□ -2.08
SME1Q12330 TWF1YGR080W 999 nt2.05□□□□□ -2.08
SME1Q12330 PEX4YGR133W 552 nt2.05□□□□□ -2.08
SME1Q12330 BTN2YGR142W 1233 nt2.05□□□□□ -2.08
SME1Q12330 PCL5YHR071W 690 nt2.05□□□□□ -2.08
SME1Q12330 YPT52YKR014C 705 nt2.05□□□□□ -2.08
SME1Q12330 RPF2YKR081C 1035 nt2.05□□□□□ -2.08
SME1Q12330 RNP1YLL046C 750 nt2.05□□□□□ -2.08
SME1Q12330 GPN3YLR243W 819 nt2.05□□□□□ -2.08
SME1Q12330 PEP12YOR036W 867 nt2.05□□□□□ -2.08
SME1Q12330 SGT1YOR057W 1188 nt2.05□□□□□ -2.08
SME1Q12330 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.05□□□□□ -2.08
SME1Q12330 RAV1YJR033C 4074 nt2.05□□□□□ -2.08
SME1Q12330 NPR1YNL183C 2373 nt2.05□□□□□ -2.08
SME1Q12330 NFT1YKR103W 3657 nt2.04□□□□□ -2.08
SME1Q12330 SLU7YDR088C 1149 nt2.04□□□□□ -2.08
SME1Q12330 HTB1YDR224C 396 nt2.04□□□□□ -2.08
SME1Q12330 YEA4YEL004W 1029 nt2.04□□□□□ -2.08
SME1Q12330 YER189WYER189W 369 nt2.04□□□□□ -2.08
SME1Q12330 MIC19YFR011C 513 nt2.04□□□□□ -2.08
SME1Q12330 ERG25YGR060W 930 nt2.04□□□□□ -2.08
SME1Q12330 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt2.04□□□□□ -2.08
SME1Q12330 POL32YJR043C 1053 nt2.04□□□□□ -2.08
SME1Q12330 TPK3YKL166C 1197 nt2.04□□□□□ -2.08
SME1Q12330 YNL046WYNL046W 519 nt2.04□□□□□ -2.08
SME1Q12330 ATG3YNR007C 933 nt2.04□□□□□ -2.08
SME1Q12330 STI1YOR027W 1770 nt2.04□□□□□ -2.08
SME1Q12330 MGE1YOR232W 687 nt2.04□□□□□ -2.08
SME1Q12330 VPS64YDR200C 1815 nt2.03□□□□□ -2.08
SME1Q12330 PCK1YKR097W 1650 nt2.03□□□□□ -2.08
SME1Q12330 RAD18YCR066W 1464 nt2.03□□□□□ -2.08
SME1Q12330 YOR296WYOR296W 3870 nt2.03□□□□□ -2.08
SME1Q12330 RAV2YDR202C 1056 nt2.03□□□□□ -2.08
SME1Q12330 RNR2YJL026W 1200 nt2.03□□□□□ -2.08
SME1Q12330 YMR187CYMR187C 1296 nt2.03□□□□□ -2.08
SME1Q12330 ARF3YOR094W 552 nt2.03□□□□□ -2.08
SME1Q12330 MBA1YBR185C 837 nt2.03□□□□□ -2.08
SME1Q12330 PBS2YJL128C 2007 nt2.03□□□□□ -2.08
SME1Q12330 YJL132WYJL132W 2253 nt2.02□□□□□ -2.09
SME1Q12330 MFB1YDR219C 1398 nt2.02□□□□□ -2.09
SME1Q12330 PDR1YGL013C 3207 nt2.02□□□□□ -2.09
SME1Q12330 UBC13YDR092W 462 nt2.02□□□□□ -2.09
SME1Q12330 TIF35YDR429C 825 nt2.02□□□□□ -2.09
SME1Q12330 RMD6YEL072W 696 nt2.02□□□□□ -2.09
SME1Q12330 YGR053CYGR053C 852 nt2.02□□□□□ -2.09
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