Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 SWC4YGR002C 1431 nt2.78□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 APC11YDL008W 498 nt2.78□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 YIL012WYIL012W 342 nt2.78□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.78□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.78□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.78□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.78□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.78□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.78□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 RNR2YJL026W 1200 nt2.78□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 RPS22AYJL190C 393 nt2.78□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 CAP1YKL007W 807 nt2.78□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 PAI3YMR174C 207 nt2.78□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 CUR1YPR158W 759 nt2.78□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 MED8YBR193C 672 nt2.78□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 BPT1YLL015W 4680 nt2.78□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 IKI3YLR384C 4050 nt2.78□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.78□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 SSN2YDR443C 4263 nt2.77□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 AXL1YPR122W 3627 nt2.77□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 SNA4YDL123W 423 nt2.77□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 KEI1YDR367W 666 nt2.77□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 PRE1YER012W 597 nt2.77□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 YFL012WYFL012W 447 nt2.77□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 EST3YIL009C-A 546 nt2.77□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt2.77□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 ADF1YCL058W-A 342 nt2.77□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 DBF20YPR111W 1695 nt2.76□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 YJL132WYJL132W 2253 nt2.76□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 GPM2YDL021W 936 nt2.76□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 YDR203WYDR203W 318 nt2.76□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 NTF2YER009W 378 nt2.76□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 YET1YKL065C 621 nt2.76□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 TDA8YAL064C-A 381 nt2.76□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 snR191snR191 274 nt2.76□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 PFF1YBR074W 2931 nt2.76□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 DNA2YHR164C 4569 nt2.76□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 NFT1YKR103W 3657 nt2.75□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 TIM11YDR322C-A 291 nt2.75□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 YIP5YGL161C 933 nt2.75□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 ERV1YGR029W 570 nt2.75□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 YLL044WYLL044W 447 nt2.75□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 VPS63YLR261C 327 nt2.75□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 AIM36YMR157C 768 nt2.75□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 RCE1YMR274C 948 nt2.75□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 HSP10YOR020C 321 nt2.75□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 RRD2YPL152W 1077 nt2.75□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 GEA1YJR031C 4227 nt2.75□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 ADY4YLR227C 1482 nt2.75□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 YDR338CYDR338C 2088 nt2.75□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 CAF120YNL278W 3183 nt2.74□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 SHS1YDL225W 1656 nt2.74□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 PGD1YGL025C 1194 nt2.74□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 RPL27AYHR010W 411 nt2.74□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 YIL174WYIL174W 228 nt2.74□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.74□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 AFT2YPL202C 1251 nt2.74□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 YPP1YGR198W 2454 nt2.74□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 NAB3YPL190C 2409 nt2.73□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 SLN1YIL147C 3663 nt2.73□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.73□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 NBP1YLR457C 960 nt2.73□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 YCL002CYCL002C 792 nt2.73□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 SSP1YHR184W 1716 nt2.73□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 FLO11YIR019C 4104 nt2.73□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 SLF1YDR515W 1344 nt2.72□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt2.72□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt2.72□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt2.72□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 YCL020WYCL020W 1317 nt2.72□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 SKT5YBL061C 2091 nt2.72□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.72□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt2.72□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 PEX18YHR160C 852 nt2.72□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 ASG7YJL170C 630 nt2.72□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 RPL17BYJL177W 555 nt2.72□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 YOL107WYOL107W 1029 nt2.72□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 LCL1YPL056C 306 nt2.72□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 ESL2YKR096W 3588 nt2.72□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 YEL1YBL060W 2064 nt2.72□□□□□ -1.97
VPS54Q12071 DUG2YBR281C 2637 nt2.71□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 YDR209CYDR209C 414 nt2.71□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 YDR248CYDR248C 582 nt2.71□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 YEA4YEL004W 1029 nt2.71□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 YMR31YFR049W 372 nt2.71□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 YGR053CYGR053C 852 nt2.71□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 RPL14BYHL001W 417 nt2.71□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 YBR051WYBR051W 351 nt2.71□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 PCK1YKR097W 1650 nt2.71□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 VHR1YIL056W 1923 nt2.71□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 BCK1YJL095W 4437 nt2.71□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 DAD1YDR016C 285 nt2.7□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 RSM18YER050C 417 nt2.7□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 RRT16YNL105W 429 nt2.7□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 YBR062CYBR062C 543 nt2.7□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 SIN3YOL004W 4611 nt2.7□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 BUB1YGR188C 3066 nt2.7□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 TMA64YDR117C 1698 nt2.69□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 SEC26YDR238C 2922 nt2.69□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 ISW1YBR245C 3390 nt2.69□□□□□ -1.98
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