Protein–RNA interactions for Protein: Q01649

CIK1, Spindle pole body-associated protein CIK1, yeastyeast

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIK1Q01649 FPR1YNL135C 345 nt2.74□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 SME1YOR159C 285 nt2.74□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 FUS1YCL027W 1539 nt2.73□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 TOR1YJR066W 7413 nt2.73□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 ICR1ICR1 3199 nt2.73□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 RSM28YDR494W 1086 nt2.73□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 LOC1YFR001W 615 nt2.73□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 YGR053CYGR053C 852 nt2.73□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 PPX1YHR201C 1194 nt2.73□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 EST3YIL009C-A 546 nt2.73□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 COX3Q0275 810 nt2.73□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 ATG27YJL178C 816 nt2.73□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 RPC25YKL144C 639 nt2.73□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 YPT52YKR014C 705 nt2.73□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 NYV1YLR093C 762 nt2.73□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 RPS1AYLR441C 768 nt2.73□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 PAI3YMR174C 207 nt2.73□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 YBR051WYBR051W 351 nt2.73□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 AFT2YPL202C 1251 nt2.73□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 SUS1YBR111W-A 291 nt2.73□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 CBP6YBR120C 489 nt2.73□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 snR42snR42 351 nt2.73□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 Q0255Q0255 1419 nt2.73□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 SKT5YBL061C 2091 nt2.73□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 SPB1YCL054W 2526 nt2.73□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 RLI1YDR091C 1827 nt2.72□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 CAF120YNL278W 3183 nt2.72□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 DNL4YOR005C 2835 nt2.72□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 SGT1YOR057W 1188 nt2.72□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt2.72□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 YBR062CYBR062C 543 nt2.72□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 PCK1YKR097W 1650 nt2.72□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 NFT1YKR103W 3657 nt2.72□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 IRA2YOL081W 9240 nt2.71□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 NUM1YDR150W 8247 nt2.71□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 BFR1YOR198C 1413 nt2.71□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 YCR013CYCR013C 648 nt2.71□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 NTF2YER009W 378 nt2.71□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 RTS3YGR161C 792 nt2.71□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 YIL174WYIL174W 228 nt2.71□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.71□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 APC9YLR102C 798 nt2.71□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 MRPL16YBL038W 699 nt2.71□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 BRX1YOL077C 876 nt2.71□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 YOL134CYOL134C 390 nt2.71□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 ISU1YPL135W 498 nt2.71□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 NTO1YPR031W 2247 nt2.7□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 ALY1YKR021W 2748 nt2.7□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 GPI19YDR437W 423 nt2.7□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.7□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 ATG3YNR007C 933 nt2.7□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 MSN1YOL116W 1149 nt2.7□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 MFB1YDR219C 1398 nt2.7□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 PUF4YGL014W 2667 nt2.7□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 COG3YER157W 2406 nt2.7□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 RLF2YPR018W 1821 nt2.7□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 SRO77YBL106C 3033 nt2.69□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 HEH2YDR458C 1992 nt2.69□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 YIP5YGL161C 933 nt2.69□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt2.69□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 ESF2YNR054C 951 nt2.69□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 PBS2YJL128C 2007 nt2.69□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 SHS1YDL225W 1656 nt2.69□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 TRZ1YKR079C 2517 nt2.69□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 UTP15YMR093W 1542 nt2.68□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 URK1YNR012W 1506 nt2.68□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 SDC25YLL016W 3147 nt2.68□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 OTU2YHL013C 924 nt2.68□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 LIN1YHR156C 1023 nt2.68□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 ASG7YJL170C 630 nt2.68□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 YET1YKL065C 621 nt2.68□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 COX8YLR395C 237 nt2.68□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.68□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 YNL319WYNL319W 441 nt2.68□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.68□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 YAP7YOL028C 738 nt2.68□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 PIS1YPR113W 663 nt2.68□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.68□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 POP7YBR167C 423 nt2.68□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 YBR287WYBR287W 1284 nt2.68□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 YCT1YLL055W 1596 nt2.68□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 TOP2YNL088W 4287 nt2.68□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 UBP16YPL072W 1500 nt2.68□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 ISW1YBR245C 3390 nt2.67□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 UBX3YDL091C 1368 nt2.67□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 snR76snR76 109 nt2.67□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt2.67□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.67□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 GRX5YPL059W 453 nt2.67□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 YKR078WYKR078W 1758 nt2.66□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 GYP7YDL234C 2241 nt2.66□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 KEL2YGR238C 2649 nt2.66□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 TAD1YGL243W 1203 nt2.66□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 YGR115CYGR115C 780 nt2.66□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 VPS63YLR261C 327 nt2.66□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 RGM1YMR182C 636 nt2.66□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 RPL36AYMR194W 303 nt2.66□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.66□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 ADF1YCL058W-A 342 nt2.66□□□□□ -1.98
CIK1Q01649 SIP3YNL257C 3690 nt2.65□□□□□ -1.98
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