Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC4BQ9NT99 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms