Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHKA1P46020 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 261.1 ms