Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 ISU2YOR226C 471 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 SSO1YPL232W 873 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 FRS2YFL022C 1512 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 SMP3YOR149C 1551 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 SIT4YDL047W 936 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 YDR187CYDR187C 519 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 YEL067CYEL067C 588 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 AIM46YHR199C 933 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 RPL6BYLR448W 531 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 YOL046CYOL046C 675 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 HSP10YOR020C 321 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 NTH2YBR001C 2343 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 YDR338CYDR338C 2088 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 YLR177WYLR177W 1887 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 BYE1YKL005C 1785 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 YNL193WYNL193W 1677 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 RPS13YDR064W 456 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 RRT13YER066W 558 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 ERG7YHR072W 2196 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 HUL5YGL141W 2733 nt5.09□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 GPG1YGL121C 381 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 VAM7YGL212W 951 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 OPY2YPR075C 1083 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 SLM6YBR266C 453 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 YDL180WYDL180W 1644 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 YCK2YNL154C 1641 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 YDL199CYDL199C 2064 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 KCC4YCL024W 3114 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 YOL153CYOL153C 1746 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 ADK1YDR226W 669 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 RPL34AYER056C-A 366 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 RPL34BYIL052C 366 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 VPS1YKR001C 2115 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 AAP1YHR047C 2571 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 YLR001CYLR001C 2589 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 NPR2YEL062W 1848 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 THI7YLR237W 1797 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 RAT1YOR048C 3021 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 EMI1YDR512C 564 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 YGL042CYGL042C 306 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 SGN1YIR001C 753 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 YLR140WYLR140W 327 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 CSR1YLR380W 1227 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 EXO1YOR033C 2109 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 GPD1YDL022W 1176 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 STE14YDR410C 720 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 SIP2YGL208W 1248 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 MVB12YGR206W 306 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 PXR1YGR280C 816 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 IRC18YJL037W 675 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 BUD20YLR074C 501 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 PIS1YPR113W 663 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 YPR114WYPR114W 948 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 SHQ1YIL104C 1524 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 ADE4YMR300C 1533 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 RNA14YMR061W 2034 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 SIP1YDR422C 2448 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 SEC6YIL068C 2418 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 HIS4YCL030C 2400 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 YHL018WYHL018W 363 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 YKL153WYKL153W 510 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 CWC24YLR323C 780 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 PCF11YDR228C 1881 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 ADE3YGR204W 2841 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 SSY5YJL156C 2100 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 YEL077CYEL077C 3834 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 YAL065CYAL065C 387 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 YPL080CYPL080C 327 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 YPR136CYPR136C 513 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 PHO88YBR106W 567 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 snR35snR35 204 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 STV1YMR054W 2673 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 YKL100CYKL100C 1764 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 FRE3YOR381W 2136 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 YLL032CYLL032C 2478 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 BCH2YKR027W 2298 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 BFA1YJR053W 1725 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-BRQ12217 MDM30YLR368W 1797 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 VTH1YIL173W 4650 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 VTH2YJL222W 4650 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 TRX3YCR083W 384 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 PAU14YIL176C 363 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 PAU1YJL223C 363 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 RPA12YJR063W 378 nt5.02□□□□□ -1.61
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