Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIRE1Q08AE8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms