Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	RSN1	YMR266W	2862 nt		2.48	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	FRE2	YKL220C	2136 nt		2.48	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	AI4	Q0065	1671 nt		2.47	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	MDM10	YAL010C	1482 nt		2.47	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	PSY2	YNL201C	2577 nt		2.47	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	DPP1	YDR284C	870 nt		2.47	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	MFA1	YDR461W	111 nt		2.47	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	YFH7	YFR007W	1062 nt		2.47	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	POL32	YJR043C	1053 nt		2.47	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	VPS25	YJR102C	609 nt		2.47	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	PSY1	YKL076C	384 nt		2.47	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	YLR169W	YLR169W	354 nt		2.47	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	DLT1	YMR126C	1029 nt		2.47	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	DIA1	YMR316W	1011 nt		2.47	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	FYV6	YNL133C	522 nt		2.47	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	YBR292C	YBR292C	372 nt		2.47	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	FLO11	YIR019C	4104 nt		2.47	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	MSH4	YFL003C	2637 nt		2.47	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	APL5	YPL195W	2799 nt		2.46	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	YPD1	YDL235C	504 nt		2.46	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	VMA8	YEL051W	771 nt		2.46	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	YER066C-A	YER066C-A	501 nt		2.46	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	TMN3	YER113C	2121 nt		2.46	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	PEX14	YGL153W	1026 nt		2.46	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	YGL159W	YGL159W	1113 nt		2.46	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	YJL169W	YJL169W	369 nt		2.46	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	CCE1	YKL011C	1062 nt		2.46	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	YLR230W	YLR230W	306 nt		2.46	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	RPL6B	YLR448W	531 nt		2.46	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	YBR209W	YBR209W	318 nt		2.46	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	PHO91	YNR013C	2685 nt		2.46	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	PDS5	YMR076C	3834 nt		2.46	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	MDM36	YPR083W	1740 nt		2.45	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	BUD26	YDR241W	288 nt		2.45	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	YIL156W-B	YIL156W-B	222 nt		2.45	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	YNL043C	YNL043C	321 nt		2.45	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	INO4	YOL108C	456 nt		2.45	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	YOL162W	YOL162W	648 nt		2.45	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	PRP8	YHR165C	7242 nt		2.45	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	YCR100C	YCR100C	951 nt		2.44	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	VTC1	YER072W	390 nt		2.44	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	YGR160W	YGR160W	612 nt		2.44	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	UBP1	YDL122W	2430 nt		2.44	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	YDR034C-C	YDR034C-C	1317 nt		2.43	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	KRE2	YDR483W	1329 nt		2.43	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	YLR410W-A	YLR410W-A	1317 nt		2.43	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	YEL010W	YEL010W	351 nt		2.43	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	RPL27A	YHR010W	411 nt		2.43	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	PSF2	YJL072C	642 nt		2.43	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	CMC1	YKL137W	336 nt		2.43	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	BOS1	YLR078C	735 nt		2.43	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	NEJ1	YLR265C	1029 nt		2.43	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	PRM6	YML047C	1059 nt		2.43	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	INP1	YMR204C	1263 nt		2.43	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	MPD2	YOL088C	834 nt		2.43	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	BTS1	YPL069C	1008 nt		2.43	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	STN1	YDR082W	1485 nt		2.43	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	MUB1	YMR100W	1863 nt		2.43	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	RGR1	YLR071C	3249 nt		2.42	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	SVL3	YPL032C	2478 nt		2.42	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	GIC2	YDR309C	1152 nt		2.42	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	GEP7	YGL057C	864 nt		2.42	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	TCD1	YHR003C	1290 nt		2.42	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	BET3	YKR068C	582 nt		2.42	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	YLR154W-E	YLR154W-E	204 nt		2.42	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	YLR366W	YLR366W	306 nt		2.42	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	YBR013C	YBR013C	390 nt		2.42	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	UTP15	YMR093W	1542 nt		2.42	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	AVT2	YEL064C	1443 nt		2.42	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	SAD1	YFR005C	1347 nt		2.42	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	YKR078W	YKR078W	1758 nt		2.41	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	BNR1	YIL159W	4128 nt		2.41	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	BOI1	YBL085W	2943 nt		2.41	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	HOP1	YIL072W	1818 nt		2.41	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	AAD16	YFL057C	459 nt		2.41	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	YGR270C-A	YGR270C-A	219 nt		2.41	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	CUP1-1	YHR053C	186 nt		2.41	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	CUP1-2	YHR055C	186 nt		2.41	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	YKL065W-A	YKL065W-A	222 nt		2.41	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	YKL070W	YKL070W	510 nt		2.41	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	YKR070W	YKR070W	1059 nt		2.41	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	MST28	YAR033W	705 nt		2.41	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	CDC123	YLR215C	1083 nt		2.41	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	RPL20A	YMR242C	519 nt		2.41	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	PDR17	YNL264C	1053 nt		2.41	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	UFE1	YOR075W	1041 nt		2.41	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	GCY1	YOR120W	939 nt		2.41	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	THI80	YOR143C	960 nt		2.41	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	YPL135C-A	YPL135C-A	174 nt		2.41	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	YPR203W	YPR203W	309 nt		2.41	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	AIM4	YBR194W	372 nt		2.41	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	MSB1	YOR188W	3414 nt		2.41	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	URK1	YNR012W	1506 nt		2.41	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	MLH1	YMR167W	2310 nt		2.41	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	SCD5	YOR329C	2619 nt		2.4	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	RTG3	YBL103C	1461 nt		2.4	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	VPS13	YLL040C	9435 nt		2.4	□□□□□ -2.02
ATG12	P38316	ERP3	YDL018C	678 nt		2.4	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	SHR3	YDL212W	633 nt		2.4	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	YER079C-A	YER079C-A	339 nt		2.4	□□□□□ -2.03

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.5 ms