Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD21O60216 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD21O60216 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD21O60216 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD21O60216 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD21O60216 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD21O60216 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD21O60216 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD21O60216 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD21O60216 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD21O60216 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD21O60216 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD21O60216 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD21O60216 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD21O60216 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD21O60216 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD21O60216 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD21O60216 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD21O60216 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD21O60216 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD21O60216 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD21O60216 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD21O60216 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD21O60216 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD21O60216 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD21O60216 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD21O60216 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD21O60216 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD21O60216 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD21O60216 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD21O60216 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD21O60216 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD21O60216 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD21O60216 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD21O60216 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD21O60216 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD21O60216 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD21O60216 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD21O60216 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD21O60216 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD21O60216 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD21O60216 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD21O60216 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD21O60216 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD21O60216 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD21O60216 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD21O60216 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD21O60216 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD21O60216 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD21O60216 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD21O60216 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD21O60216 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD21O60216 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD21O60216 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD21O60216 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD21O60216 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD21O60216 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD21O60216 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD21O60216 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD21O60216 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD21O60216 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD21O60216 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD21O60216 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD21O60216 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD21O60216 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD21O60216 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD21O60216 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD21O60216 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD21O60216 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD21O60216 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD21O60216 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD21O60216 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD21O60216 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD21O60216 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD21O60216 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD21O60216 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD21O60216 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD21O60216 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD21O60216 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD21O60216 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD21O60216 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD21O60216 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD21O60216 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD21O60216 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD21O60216 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD21O60216 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD21O60216 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD21O60216 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD21O60216 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD21O60216 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD21O60216 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD21O60216 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD21O60216 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD21O60216 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD21O60216 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD21O60216 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD21O60216 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD21O60216 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD21O60216 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD21O60216 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms