Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms