Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIRE1Q08AE8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms