Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms