Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNI3KQ59H18 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNI3KQ59H18 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNI3KQ59H18 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNI3KQ59H18 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNI3KQ59H18 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNI3KQ59H18 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNI3KQ59H18 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNI3KQ59H18 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNI3KQ59H18 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNI3KQ59H18 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNI3KQ59H18 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNI3KQ59H18 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNI3KQ59H18 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNI3KQ59H18 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNI3KQ59H18 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNI3KQ59H18 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNI3KQ59H18 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNI3KQ59H18 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNI3KQ59H18 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNI3KQ59H18 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNI3KQ59H18 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNI3KQ59H18 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNI3KQ59H18 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNI3KQ59H18 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNI3KQ59H18 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNI3KQ59H18 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNI3KQ59H18 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNI3KQ59H18 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNNI3KQ59H18 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNNI3KQ59H18 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNNI3KQ59H18 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNNI3KQ59H18 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI3KQ59H18 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms