Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PTPRKQ15262 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRKQ15262 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
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