Protein–RNA interactions for Protein: Q12028

APL4, AP-1 complex subunit gamma-1, yeastyeast

Predictions only

Length 832 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APL4Q12028 ATG10YLL042C 504 nt3.38□□□□□ -1.87
APL4Q12028 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.38□□□□□ -1.87
APL4Q12028 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.38□□□□□ -1.87
APL4Q12028 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.38□□□□□ -1.87
APL4Q12028 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.38□□□□□ -1.87
APL4Q12028 MST28YAR033W 705 nt3.38□□□□□ -1.87
APL4Q12028 ADF1YCL058W-A 342 nt3.38□□□□□ -1.87
APL4Q12028 AEP1YMR064W 1557 nt3.38□□□□□ -1.87
APL4Q12028 MRS2YOR334W 1413 nt3.37□□□□□ -1.87
APL4Q12028 OPI6YDL096C 327 nt3.37□□□□□ -1.87
APL4Q12028 RAV2YDR202C 1056 nt3.37□□□□□ -1.87
APL4Q12028 KEI1YDR367W 666 nt3.37□□□□□ -1.87
APL4Q12028 RSM28YDR494W 1086 nt3.37□□□□□ -1.87
APL4Q12028 SUP56tL(CAA)A 82 nt3.37□□□□□ -1.87
APL4Q12028 SUP53tL(CAA)C 82 nt3.37□□□□□ -1.87
APL4Q12028 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt3.37□□□□□ -1.87
APL4Q12028 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt3.37□□□□□ -1.87
APL4Q12028 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.37□□□□□ -1.87
APL4Q12028 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.37□□□□□ -1.87
APL4Q12028 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.37□□□□□ -1.87
APL4Q12028 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.37□□□□□ -1.87
APL4Q12028 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.37□□□□□ -1.87
APL4Q12028 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.37□□□□□ -1.87
APL4Q12028 BRR6YGL247W 594 nt3.37□□□□□ -1.87
APL4Q12028 QCR10YHR001W-A 234 nt3.37□□□□□ -1.87
APL4Q12028 DAL2YIR029W 1032 nt3.37□□□□□ -1.87
APL4Q12028 TPK3YKL166C 1197 nt3.37□□□□□ -1.87
APL4Q12028 RPN13YLR421C 471 nt3.37□□□□□ -1.87
APL4Q12028 YMR141CYMR141C 309 nt3.37□□□□□ -1.87
APL4Q12028 YNR062CYNR062C 984 nt3.37□□□□□ -1.87
APL4Q12028 CHS3YBR023C 3498 nt3.37□□□□□ -1.87
APL4Q12028 VIP1YLR410W 3441 nt3.37□□□□□ -1.87
APL4Q12028 TCP1YDR212W 1680 nt3.36□□□□□ -1.87
APL4Q12028 STT4YLR305C 5703 nt3.36□□□□□ -1.87
APL4Q12028 OCA6YDR067C 675 nt3.36□□□□□ -1.87
APL4Q12028 EMC4YGL231C 573 nt3.36□□□□□ -1.87
APL4Q12028 MDV1YJL112W 2145 nt3.36□□□□□ -1.87
APL4Q12028 BUD19YJL188C 309 nt3.36□□□□□ -1.87
APL4Q12028 SFT1YKL006C-A 294 nt3.36□□□□□ -1.87
APL4Q12028 ERG2YMR202W 669 nt3.36□□□□□ -1.87
APL4Q12028 SSN8YNL025C 972 nt3.36□□□□□ -1.87
APL4Q12028 GIM3YNL153C 390 nt3.36□□□□□ -1.87
APL4Q12028 AAR2YBL074C 1068 nt3.36□□□□□ -1.87
APL4Q12028 SRL1YOR247W 633 nt3.36□□□□□ -1.87
APL4Q12028 CDH1YGL003C 1701 nt3.36□□□□□ -1.87
APL4Q12028 YMR018WYMR018W 1545 nt3.35□□□□□ -1.87
APL4Q12028 YGL152CYGL152C 678 nt3.35□□□□□ -1.87
APL4Q12028 EFG1YGR271C-A 702 nt3.35□□□□□ -1.87
APL4Q12028 YKR011CYKR011C 1062 nt3.35□□□□□ -1.87
APL4Q12028 YOR283WYOR283W 693 nt3.35□□□□□ -1.87
APL4Q12028 DPB3YBR278W 606 nt3.35□□□□□ -1.87
APL4Q12028 SMC2YFR031C 3513 nt3.35□□□□□ -1.87
APL4Q12028 SLF1YDR515W 1344 nt3.35□□□□□ -1.87
APL4Q12028 ITT1YML068W 1395 nt3.35□□□□□ -1.87
APL4Q12028 FUN30YAL019W 3396 nt3.35□□□□□ -1.87
APL4Q12028 REG1YDR028C 3045 nt3.35□□□□□ -1.87
APL4Q12028 CHO2YGR157W 2610 nt3.35□□□□□ -1.87
APL4Q12028 UBP14YBR058C 2346 nt3.35□□□□□ -1.87
APL4Q12028 POL2YNL262W 6669 nt3.34□□□□□ -1.87
APL4Q12028 CIK1YMR198W 1785 nt3.34□□□□□ -1.87
APL4Q12028 CRD1YDL142C 852 nt3.34□□□□□ -1.87
APL4Q12028 DTD1YDL219W 453 nt3.34□□□□□ -1.87
APL4Q12028 SLU7YDR088C 1149 nt3.34□□□□□ -1.87
APL4Q12028 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt3.34□□□□□ -1.87
APL4Q12028 YIP1YGR172C 747 nt3.34□□□□□ -1.87
APL4Q12028 YOL029CYOL029C 606 nt3.34□□□□□ -1.87
APL4Q12028 CTF13YMR094W 1437 nt3.34□□□□□ -1.88
APL4Q12028 APC5YOR249C 2058 nt3.34□□□□□ -1.88
APL4Q12028 YDL180WYDL180W 1644 nt3.33□□□□□ -1.88
APL4Q12028 EPL1YFL024C 2499 nt3.33□□□□□ -1.88
APL4Q12028 MDM1YML104C 3384 nt3.33□□□□□ -1.88
APL4Q12028 BSC1YDL037C 987 nt3.33□□□□□ -1.88
APL4Q12028 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt3.33□□□□□ -1.88
APL4Q12028 AGE2YIL044C 897 nt3.33□□□□□ -1.88
APL4Q12028 IST3YIR005W 447 nt3.33□□□□□ -1.88
APL4Q12028 SEC14YMR079W 915 nt3.33□□□□□ -1.88
APL4Q12028 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt3.33□□□□□ -1.88
APL4Q12028 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt3.33□□□□□ -1.88
APL4Q12028 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt3.33□□□□□ -1.88
APL4Q12028 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt3.33□□□□□ -1.88
APL4Q12028 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt3.33□□□□□ -1.88
APL4Q12028 YCL020WYCL020W 1317 nt3.33□□□□□ -1.88
APL4Q12028 AKR1YDR264C 2295 nt3.33□□□□□ -1.88
APL4Q12028 PSP1YDR505C 2526 nt3.33□□□□□ -1.88
APL4Q12028 MAK21YDR060W 3078 nt3.33□□□□□ -1.88
APL4Q12028 ATG13YPR185W 2217 nt3.32□□□□□ -1.88
APL4Q12028 UBP5YER144C 2418 nt3.32□□□□□ -1.88
APL4Q12028 snR68snR68 136 nt3.32□□□□□ -1.88
APL4Q12028 HTA1YDR225W 399 nt3.32□□□□□ -1.88
APL4Q12028 TMA20YER007C-A 546 nt3.32□□□□□ -1.88
APL4Q12028 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.32□□□□□ -1.88
APL4Q12028 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.32□□□□□ -1.88
APL4Q12028 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.32□□□□□ -1.88
APL4Q12028 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.32□□□□□ -1.88
APL4Q12028 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.32□□□□□ -1.88
APL4Q12028 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.32□□□□□ -1.88
APL4Q12028 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.32□□□□□ -1.88
APL4Q12028 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.32□□□□□ -1.88
APL4Q12028 YFH7YFR007W 1062 nt3.32□□□□□ -1.88
APL4Q12028 CDC26YFR036W 375 nt3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 43.6 ms