Protein–RNA interactions for Protein: Q03702

CCE1, Cruciform cutting endonuclease 1, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCE1Q03702 ARL1YBR164C 552 nt2.9□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 VAS1YGR094W 3315 nt2.9□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 CST9YLR394W 1449 nt2.9□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 PEX6YNL329C 3093 nt2.9□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 RAD5YLR032W 3510 nt2.9□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 FAR1YJL157C 2493 nt2.9□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 YGR237CYGR237C 2358 nt2.89□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 YEA4YEL004W 1029 nt2.89□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt2.89□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 EPL1YFL024C 2499 nt2.89□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 YFH7YFR007W 1062 nt2.89□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt2.89□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 PPX1YHR201C 1194 nt2.89□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 VMA5YKL080W 1179 nt2.89□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 YLR217WYLR217W 324 nt2.89□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 LIP2YLR239C 987 nt2.89□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 RPL6BYLR448W 531 nt2.89□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 RIM9YMR063W 720 nt2.89□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 PEX11YOL147C 711 nt2.89□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 LCB4YOR171C 1875 nt2.89□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 YPR053CYPR053C 456 nt2.89□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 CBP6YBR120C 489 nt2.89□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 SRP1YNL189W 1629 nt2.89□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 YLR446WYLR446W 1302 nt2.89□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 URK1YNR012W 1506 nt2.88□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 RPN1YHR027C 2982 nt2.88□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 PHO81YGR233C 3537 nt2.88□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 AEP1YMR064W 1557 nt2.88□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 YDL242WYDL242W 354 nt2.88□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 RPL23BYER117W 414 nt2.88□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 YGR073CYGR073C 372 nt2.88□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 EST3YIL009C-A 546 nt2.88□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 DLS1YJL065C 504 nt2.88□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 SMA2YML066C 1110 nt2.88□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 COX14YML129C 213 nt2.88□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 ATG3YNR007C 933 nt2.88□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 snR24snR24 89 nt2.88□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 BCH1YMR237W 2175 nt2.88□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt2.88□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt2.88□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 YMR046CYMR046C 1323 nt2.88□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 FAA2YER015W 2235 nt2.88□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 ROG1YGL144C 2058 nt2.88□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 FUN30YAL019W 3396 nt2.87□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 CIN1YOR349W 3045 nt2.87□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 YDL180WYDL180W 1644 nt2.87□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 YPR1YDR368W 939 nt2.87□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 VAB2YEL005C 849 nt2.87□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 YFL015CYFL015C 495 nt2.87□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 YGL082WYGL082W 1146 nt2.87□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 LIF1YGL090W 1266 nt2.87□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 GOS1YHL031C 672 nt2.87□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 YOL114CYOL114C 609 nt2.87□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 snR189snR189 189 nt2.87□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 APM3YBR288C 1452 nt2.87□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 ARP5YNL059C 2268 nt2.87□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 HEH2YDR458C 1992 nt2.87□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 RAD18YCR066W 1464 nt2.86□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 CYR1YJL005W 6081 nt2.86□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 TIF4631YGR162W 2859 nt2.86□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 MDM36YPR083W 1740 nt2.86□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 THO1YER063W 657 nt2.86□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 YGR017WYGR017W 894 nt2.86□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 LST7YGR057C 729 nt2.86□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 YGR115CYGR115C 780 nt2.86□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 YJL032WYJL032W 315 nt2.86□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 NBP1YLR457C 960 nt2.86□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 RPL13BYMR142C 600 nt2.86□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 YNL050CYNL050C 813 nt2.86□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 TPT1YOL102C 693 nt2.86□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 INO4YOL108C 456 nt2.86□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 YPR050CYPR050C 414 nt2.86□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 LTP1YPR073C 486 nt2.86□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 RXT2YBR095C 1293 nt2.86□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 CSR2YPR030W 3366 nt2.86□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 RSE1YML049C 4086 nt2.86□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 JJJ1YNL227C 1773 nt2.86□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 YNL011CYNL011C 1335 nt2.86□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt2.86□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 SRP68YPL243W 1800 nt2.86□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 IOC3YFR013W 2364 nt2.85□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 UBC13YDR092W 462 nt2.85□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 DIG2YDR480W 972 nt2.85□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 RMD6YEL072W 696 nt2.85□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 HMF1YER057C 390 nt2.85□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 SMX2YFL017W-A 234 nt2.85□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 YIL175WYIL175W 318 nt2.85□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt2.85□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 YKL115CYKL115C 393 nt2.85□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 ATG10YLL042C 504 nt2.85□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 RPN13YLR421C 471 nt2.85□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 RHO5YNL180C 996 nt2.85□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 YNL184CYNL184C 327 nt2.85□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 RRG7YOR305W 729 nt2.85□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 POP7YBR167C 423 nt2.85□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 ORC1YML065W 2745 nt2.85□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 STP2YHR006W 1626 nt2.85□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 SPO71YDR104C 3738 nt2.85□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 CDC37YDR168W 1521 nt2.84□□□□□ -1.95
CCE1Q03702 NOP56YLR197W 1515 nt2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23 ms