Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms