Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Zcchc17Q9ESX4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Zcchc17Q9ESX4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Zcchc17Q9ESX4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Zcchc17Q9ESX4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Zcchc17Q9ESX4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Zcchc17Q9ESX4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Zcchc17Q9ESX4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Zcchc17Q9ESX4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Zcchc17Q9ESX4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Zcchc17Q9ESX4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Zcchc17Q9ESX4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Zcchc17Q9ESX4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Zcchc17Q9ESX4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Zcchc17Q9ESX4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Zcchc17Q9ESX4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Zcchc17Q9ESX4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Zcchc17Q9ESX4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Zcchc17Q9ESX4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Zcchc17Q9ESX4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Zcchc17Q9ESX4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Zcchc17Q9ESX4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Zcchc17Q9ESX4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Zcchc17Q9ESX4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Zcchc17Q9ESX4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Zcchc17Q9ESX4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Zcchc17Q9ESX4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Zcchc17Q9ESX4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Zcchc17Q9ESX4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Zcchc17Q9ESX4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Zcchc17Q9ESX4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Zcchc17Q9ESX4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Zcchc17Q9ESX4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Zcchc17Q9ESX4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Zcchc17Q9ESX4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Zcchc17Q9ESX4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Zcchc17Q9ESX4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Zcchc17Q9ESX4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Zcchc17Q9ESX4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Zcchc17Q9ESX4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Zcchc17Q9ESX4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Zcchc17Q9ESX4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Zcchc17Q9ESX4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Zcchc17Q9ESX4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Zcchc17Q9ESX4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Zcchc17Q9ESX4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Zcchc17Q9ESX4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Zcchc17Q9ESX4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Zcchc17Q9ESX4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Zcchc17Q9ESX4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Zcchc17Q9ESX4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Zcchc17Q9ESX4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Zcchc17Q9ESX4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Zcchc17Q9ESX4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Zcchc17Q9ESX4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Zcchc17Q9ESX4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Zcchc17Q9ESX4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Zcchc17Q9ESX4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Zcchc17Q9ESX4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Zcchc17Q9ESX4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Zcchc17Q9ESX4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Zcchc17Q9ESX4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Zcchc17Q9ESX4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Zcchc17Q9ESX4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Zcchc17Q9ESX4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Zcchc17Q9ESX4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Zcchc17Q9ESX4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Zcchc17Q9ESX4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Zcchc17Q9ESX4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Zcchc17Q9ESX4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Zcchc17Q9ESX4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Zcchc17Q9ESX4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Zcchc17Q9ESX4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Zcchc17Q9ESX4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Zcchc17Q9ESX4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Zcchc17Q9ESX4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Zcchc17Q9ESX4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Zcchc17Q9ESX4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Zcchc17Q9ESX4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Zcchc17Q9ESX4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Zcchc17Q9ESX4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Zcchc17Q9ESX4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Zcchc17Q9ESX4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Zcchc17Q9ESX4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Zcchc17Q9ESX4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Zcchc17Q9ESX4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Zcchc17Q9ESX4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Zcchc17Q9ESX4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zcchc17Q9ESX4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zcchc17Q9ESX4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zcchc17Q9ESX4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zcchc17Q9ESX4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Zcchc17Q9ESX4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Zcchc17Q9ESX4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Zcchc17Q9ESX4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Zcchc17Q9ESX4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Zcchc17Q9ESX4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zcchc17Q9ESX4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zcchc17Q9ESX4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Zcchc17Q9ESX4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms