Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b5Q923D4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3b5Q923D4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3b5Q923D4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b5Q923D4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b5Q923D4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b5Q923D4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b5Q923D4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b5Q923D4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b5Q923D4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b5Q923D4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b5Q923D4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b5Q923D4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sf3b5Q923D4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b5Q923D4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b5Q923D4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b5Q923D4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b5Q923D4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b5Q923D4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b5Q923D4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b5Q923D4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b5Q923D4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b5Q923D4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b5Q923D4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b5Q923D4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b5Q923D4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b5Q923D4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b5Q923D4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b5Q923D4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b5Q923D4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b5Q923D4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b5Q923D4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b5Q923D4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b5Q923D4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b5Q923D4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b5Q923D4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b5Q923D4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b5Q923D4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b5Q923D4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b5Q923D4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sf3b5Q923D4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sf3b5Q923D4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sf3b5Q923D4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b5Q923D4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b5Q923D4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b5Q923D4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf3b5Q923D4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf3b5Q923D4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3b5Q923D4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3b5Q923D4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b5Q923D4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b5Q923D4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b5Q923D4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b5Q923D4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b5Q923D4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sf3b5Q923D4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b5Q923D4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b5Q923D4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b5Q923D4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf3b5Q923D4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf3b5Q923D4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf3b5Q923D4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf3b5Q923D4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3b5Q923D4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3b5Q923D4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b5Q923D4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3b5Q923D4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3b5Q923D4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf3b5Q923D4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf3b5Q923D4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sf3b5Q923D4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sf3b5Q923D4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sf3b5Q923D4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sf3b5Q923D4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3b5Q923D4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3b5Q923D4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf3b5Q923D4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf3b5Q923D4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf3b5Q923D4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sf3b5Q923D4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sf3b5Q923D4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b5Q923D4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sf3b5Q923D4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sf3b5Q923D4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sf3b5Q923D4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b5Q923D4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b5Q923D4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b5Q923D4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b5Q923D4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b5Q923D4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3b5Q923D4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3b5Q923D4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3b5Q923D4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3b5Q923D4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf3b5Q923D4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf3b5Q923D4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b5Q923D4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b5Q923D4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf3b5Q923D4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3b5Q923D4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms