Protein–RNA interactions for Protein: Q91VS8

Farp2, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp2Q91VS8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Farp2Q91VS8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Farp2Q91VS8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Farp2Q91VS8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Farp2Q91VS8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Farp2Q91VS8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Farp2Q91VS8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Farp2Q91VS8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Farp2Q91VS8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Farp2Q91VS8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Farp2Q91VS8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Farp2Q91VS8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Farp2Q91VS8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Farp2Q91VS8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Farp2Q91VS8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Farp2Q91VS8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Farp2Q91VS8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Farp2Q91VS8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Farp2Q91VS8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Farp2Q91VS8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Farp2Q91VS8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Farp2Q91VS8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Farp2Q91VS8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Farp2Q91VS8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Farp2Q91VS8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Farp2Q91VS8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Farp2Q91VS8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Farp2Q91VS8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Farp2Q91VS8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Farp2Q91VS8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Farp2Q91VS8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Farp2Q91VS8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Farp2Q91VS8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Farp2Q91VS8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Farp2Q91VS8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Farp2Q91VS8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Farp2Q91VS8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Farp2Q91VS8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Farp2Q91VS8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Farp2Q91VS8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Farp2Q91VS8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Farp2Q91VS8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Farp2Q91VS8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Farp2Q91VS8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Farp2Q91VS8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Farp2Q91VS8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Farp2Q91VS8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Farp2Q91VS8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Farp2Q91VS8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Farp2Q91VS8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Farp2Q91VS8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Farp2Q91VS8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Farp2Q91VS8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Farp2Q91VS8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Farp2Q91VS8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Farp2Q91VS8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Farp2Q91VS8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Farp2Q91VS8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Farp2Q91VS8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Farp2Q91VS8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Farp2Q91VS8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Farp2Q91VS8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Farp2Q91VS8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Farp2Q91VS8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Farp2Q91VS8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Farp2Q91VS8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Farp2Q91VS8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Farp2Q91VS8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Farp2Q91VS8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Farp2Q91VS8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Farp2Q91VS8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Farp2Q91VS8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Farp2Q91VS8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Farp2Q91VS8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Farp2Q91VS8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Farp2Q91VS8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Farp2Q91VS8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Farp2Q91VS8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Farp2Q91VS8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Farp2Q91VS8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Farp2Q91VS8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Farp2Q91VS8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Farp2Q91VS8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Farp2Q91VS8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Farp2Q91VS8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Farp2Q91VS8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Farp2Q91VS8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Farp2Q91VS8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Farp2Q91VS8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Farp2Q91VS8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Farp2Q91VS8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Farp2Q91VS8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Farp2Q91VS8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Farp2Q91VS8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Farp2Q91VS8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
Farp2Q91VS8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Farp2Q91VS8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Farp2Q91VS8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Farp2Q91VS8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Farp2Q91VS8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms