Protein–RNA interactions for Protein: Q8R268

Vmn1r212, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r212Q8R268 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r212Q8R268 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r212Q8R268 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r212Q8R268 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r212Q8R268 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r212Q8R268 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r212Q8R268 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r212Q8R268 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r212Q8R268 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r212Q8R268 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r212Q8R268 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r212Q8R268 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn1r212Q8R268 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn1r212Q8R268 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r212Q8R268 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r212Q8R268 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r212Q8R268 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r212Q8R268 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r212Q8R268 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r212Q8R268 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r212Q8R268 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r212Q8R268 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r212Q8R268 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r212Q8R268 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r212Q8R268 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r212Q8R268 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r212Q8R268 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r212Q8R268 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r212Q8R268 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r212Q8R268 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r212Q8R268 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r212Q8R268 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r212Q8R268 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r212Q8R268 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r212Q8R268 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r212Q8R268 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r212Q8R268 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r212Q8R268 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r212Q8R268 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r212Q8R268 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r212Q8R268 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vmn1r212Q8R268 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vmn1r212Q8R268 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r212Q8R268 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r212Q8R268 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r212Q8R268 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r212Q8R268 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r212Q8R268 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r212Q8R268 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r212Q8R268 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r212Q8R268 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r212Q8R268 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r212Q8R268 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r212Q8R268 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r212Q8R268 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r212Q8R268 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r212Q8R268 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vmn1r212Q8R268 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r212Q8R268 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r212Q8R268 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r212Q8R268 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r212Q8R268 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r212Q8R268 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r212Q8R268 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r212Q8R268 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r212Q8R268 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r212Q8R268 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r212Q8R268 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r212Q8R268 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r212Q8R268 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r212Q8R268 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r212Q8R268 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r212Q8R268 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r212Q8R268 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r212Q8R268 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r212Q8R268 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r212Q8R268 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r212Q8R268 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r212Q8R268 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r212Q8R268 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r212Q8R268 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r212Q8R268 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r212Q8R268 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r212Q8R268 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r212Q8R268 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r212Q8R268 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r212Q8R268 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r212Q8R268 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r212Q8R268 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r212Q8R268 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r212Q8R268 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r212Q8R268 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r212Q8R268 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r212Q8R268 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r212Q8R268 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r212Q8R268 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r212Q8R268 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r212Q8R268 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r212Q8R268 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r212Q8R268 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms