Protein–RNA interactions for Protein: Q8R268

Vmn1r212, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r212Q8R268 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Vmn1r212Q8R268 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Vmn1r212Q8R268 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Vmn1r212Q8R268 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Vmn1r212Q8R268 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Vmn1r212Q8R268 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Vmn1r212Q8R268 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Vmn1r212Q8R268 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Vmn1r212Q8R268 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Vmn1r212Q8R268 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Vmn1r212Q8R268 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Vmn1r212Q8R268 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vmn1r212Q8R268 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Vmn1r212Q8R268 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Vmn1r212Q8R268 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Vmn1r212Q8R268 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Vmn1r212Q8R268 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Vmn1r212Q8R268 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Vmn1r212Q8R268 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vmn1r212Q8R268 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vmn1r212Q8R268 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vmn1r212Q8R268 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Vmn1r212Q8R268 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vmn1r212Q8R268 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vmn1r212Q8R268 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vmn1r212Q8R268 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vmn1r212Q8R268 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Vmn1r212Q8R268 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vmn1r212Q8R268 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Vmn1r212Q8R268 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Vmn1r212Q8R268 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Vmn1r212Q8R268 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vmn1r212Q8R268 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vmn1r212Q8R268 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vmn1r212Q8R268 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vmn1r212Q8R268 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vmn1r212Q8R268 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Vmn1r212Q8R268 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vmn1r212Q8R268 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vmn1r212Q8R268 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vmn1r212Q8R268 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vmn1r212Q8R268 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vmn1r212Q8R268 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vmn1r212Q8R268 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vmn1r212Q8R268 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vmn1r212Q8R268 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vmn1r212Q8R268 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Vmn1r212Q8R268 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Vmn1r212Q8R268 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vmn1r212Q8R268 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vmn1r212Q8R268 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vmn1r212Q8R268 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vmn1r212Q8R268 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vmn1r212Q8R268 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Vmn1r212Q8R268 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vmn1r212Q8R268 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vmn1r212Q8R268 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vmn1r212Q8R268 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vmn1r212Q8R268 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vmn1r212Q8R268 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Vmn1r212Q8R268 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vmn1r212Q8R268 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vmn1r212Q8R268 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vmn1r212Q8R268 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vmn1r212Q8R268 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vmn1r212Q8R268 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vmn1r212Q8R268 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vmn1r212Q8R268 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vmn1r212Q8R268 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vmn1r212Q8R268 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vmn1r212Q8R268 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vmn1r212Q8R268 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vmn1r212Q8R268 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Vmn1r212Q8R268 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vmn1r212Q8R268 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vmn1r212Q8R268 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vmn1r212Q8R268 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vmn1r212Q8R268 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Vmn1r212Q8R268 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vmn1r212Q8R268 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vmn1r212Q8R268 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Vmn1r212Q8R268 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Vmn1r212Q8R268 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vmn1r212Q8R268 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vmn1r212Q8R268 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vmn1r212Q8R268 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vmn1r212Q8R268 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vmn1r212Q8R268 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vmn1r212Q8R268 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vmn1r212Q8R268 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vmn1r212Q8R268 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vmn1r212Q8R268 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vmn1r212Q8R268 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vmn1r212Q8R268 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vmn1r212Q8R268 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vmn1r212Q8R268 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vmn1r212Q8R268 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vmn1r212Q8R268 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Vmn1r212Q8R268 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vmn1r212Q8R268 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms