Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc28Q80XJ3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc28Q80XJ3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc28Q80XJ3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc28Q80XJ3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc28Q80XJ3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc28Q80XJ3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc28Q80XJ3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc28Q80XJ3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc28Q80XJ3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc28Q80XJ3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc28Q80XJ3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc28Q80XJ3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc28Q80XJ3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc28Q80XJ3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc28Q80XJ3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc28Q80XJ3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc28Q80XJ3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc28Q80XJ3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc28Q80XJ3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc28Q80XJ3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc28Q80XJ3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc28Q80XJ3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc28Q80XJ3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc28Q80XJ3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc28Q80XJ3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc28Q80XJ3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc28Q80XJ3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc28Q80XJ3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc28Q80XJ3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc28Q80XJ3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc28Q80XJ3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc28Q80XJ3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc28Q80XJ3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc28Q80XJ3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc28Q80XJ3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc28Q80XJ3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc28Q80XJ3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc28Q80XJ3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc28Q80XJ3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc28Q80XJ3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc28Q80XJ3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc28Q80XJ3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc28Q80XJ3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc28Q80XJ3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc28Q80XJ3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc28Q80XJ3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc28Q80XJ3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc28Q80XJ3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc28Q80XJ3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc28Q80XJ3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc28Q80XJ3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc28Q80XJ3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc28Q80XJ3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc28Q80XJ3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc28Q80XJ3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc28Q80XJ3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc28Q80XJ3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc28Q80XJ3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc28Q80XJ3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc28Q80XJ3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc28Q80XJ3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc28Q80XJ3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc28Q80XJ3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc28Q80XJ3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc28Q80XJ3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc28Q80XJ3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc28Q80XJ3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc28Q80XJ3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc28Q80XJ3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc28Q80XJ3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc28Q80XJ3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc28Q80XJ3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc28Q80XJ3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc28Q80XJ3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc28Q80XJ3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc28Q80XJ3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc28Q80XJ3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc28Q80XJ3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc28Q80XJ3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc28Q80XJ3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc28Q80XJ3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc28Q80XJ3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc28Q80XJ3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc28Q80XJ3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc28Q80XJ3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc28Q80XJ3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc28Q80XJ3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc28Q80XJ3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc28Q80XJ3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc28Q80XJ3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc28Q80XJ3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc28Q80XJ3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc28Q80XJ3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc28Q80XJ3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc28Q80XJ3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc28Q80XJ3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttc28Q80XJ3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttc28Q80XJ3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttc28Q80XJ3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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