Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWU9

Acaca, Acetyl-CoA carboxylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcacaQ5SWU9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AcacaQ5SWU9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
AcacaQ5SWU9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AcacaQ5SWU9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AcacaQ5SWU9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AcacaQ5SWU9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AcacaQ5SWU9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AcacaQ5SWU9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AcacaQ5SWU9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AcacaQ5SWU9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AcacaQ5SWU9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AcacaQ5SWU9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AcacaQ5SWU9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AcacaQ5SWU9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AcacaQ5SWU9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AcacaQ5SWU9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AcacaQ5SWU9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AcacaQ5SWU9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AcacaQ5SWU9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AcacaQ5SWU9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AcacaQ5SWU9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AcacaQ5SWU9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AcacaQ5SWU9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AcacaQ5SWU9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
AcacaQ5SWU9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AcacaQ5SWU9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AcacaQ5SWU9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AcacaQ5SWU9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AcacaQ5SWU9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AcacaQ5SWU9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AcacaQ5SWU9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AcacaQ5SWU9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AcacaQ5SWU9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AcacaQ5SWU9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AcacaQ5SWU9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AcacaQ5SWU9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AcacaQ5SWU9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AcacaQ5SWU9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AcacaQ5SWU9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AcacaQ5SWU9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AcacaQ5SWU9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AcacaQ5SWU9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AcacaQ5SWU9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AcacaQ5SWU9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AcacaQ5SWU9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AcacaQ5SWU9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
AcacaQ5SWU9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AcacaQ5SWU9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AcacaQ5SWU9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AcacaQ5SWU9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AcacaQ5SWU9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AcacaQ5SWU9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AcacaQ5SWU9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AcacaQ5SWU9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AcacaQ5SWU9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AcacaQ5SWU9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AcacaQ5SWU9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AcacaQ5SWU9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AcacaQ5SWU9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AcacaQ5SWU9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AcacaQ5SWU9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AcacaQ5SWU9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AcacaQ5SWU9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AcacaQ5SWU9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AcacaQ5SWU9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AcacaQ5SWU9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AcacaQ5SWU9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AcacaQ5SWU9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AcacaQ5SWU9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AcacaQ5SWU9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AcacaQ5SWU9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AcacaQ5SWU9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AcacaQ5SWU9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AcacaQ5SWU9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AcacaQ5SWU9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AcacaQ5SWU9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AcacaQ5SWU9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AcacaQ5SWU9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AcacaQ5SWU9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AcacaQ5SWU9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AcacaQ5SWU9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AcacaQ5SWU9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AcacaQ5SWU9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AcacaQ5SWU9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AcacaQ5SWU9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AcacaQ5SWU9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AcacaQ5SWU9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AcacaQ5SWU9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AcacaQ5SWU9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AcacaQ5SWU9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AcacaQ5SWU9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AcacaQ5SWU9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AcacaQ5SWU9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AcacaQ5SWU9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AcacaQ5SWU9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AcacaQ5SWU9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AcacaQ5SWU9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AcacaQ5SWU9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AcacaQ5SWU9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AcacaQ5SWU9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms