Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Gtpbp6Q3U6U5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Gtpbp6Q3U6U5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Gtpbp6Q3U6U5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Gtpbp6Q3U6U5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Gtpbp6Q3U6U5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Gtpbp6Q3U6U5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Gtpbp6Q3U6U5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Gtpbp6Q3U6U5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Gtpbp6Q3U6U5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Gtpbp6Q3U6U5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Gtpbp6Q3U6U5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Gtpbp6Q3U6U5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Gtpbp6Q3U6U5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Gtpbp6Q3U6U5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gtpbp6Q3U6U5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Gtpbp6Q3U6U5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Gtpbp6Q3U6U5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Gtpbp6Q3U6U5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Gtpbp6Q3U6U5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Gtpbp6Q3U6U5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Gtpbp6Q3U6U5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Gtpbp6Q3U6U5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Gtpbp6Q3U6U5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Gtpbp6Q3U6U5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Gtpbp6Q3U6U5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Gtpbp6Q3U6U5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Gtpbp6Q3U6U5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gtpbp6Q3U6U5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gtpbp6Q3U6U5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Gtpbp6Q3U6U5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gtpbp6Q3U6U5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gtpbp6Q3U6U5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Gtpbp6Q3U6U5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Gtpbp6Q3U6U5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Gtpbp6Q3U6U5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Gtpbp6Q3U6U5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Gtpbp6Q3U6U5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Gtpbp6Q3U6U5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Gtpbp6Q3U6U5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gtpbp6Q3U6U5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gtpbp6Q3U6U5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Gtpbp6Q3U6U5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Gtpbp6Q3U6U5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Gtpbp6Q3U6U5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Gtpbp6Q3U6U5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Gtpbp6Q3U6U5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gtpbp6Q3U6U5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gtpbp6Q3U6U5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gtpbp6Q3U6U5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Gtpbp6Q3U6U5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gtpbp6Q3U6U5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gtpbp6Q3U6U5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gtpbp6Q3U6U5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Gtpbp6Q3U6U5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gtpbp6Q3U6U5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gtpbp6Q3U6U5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Gtpbp6Q3U6U5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Gtpbp6Q3U6U5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gtpbp6Q3U6U5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gtpbp6Q3U6U5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Gtpbp6Q3U6U5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gtpbp6Q3U6U5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gtpbp6Q3U6U5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gtpbp6Q3U6U5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gtpbp6Q3U6U5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Gtpbp6Q3U6U5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gtpbp6Q3U6U5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Gtpbp6Q3U6U5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Gtpbp6Q3U6U5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gtpbp6Q3U6U5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gtpbp6Q3U6U5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gtpbp6Q3U6U5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Gtpbp6Q3U6U5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gtpbp6Q3U6U5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
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