Protein–RNA interactions for Protein: Q148W8

Dusp27, Inactive dual specificity phosphatase 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp27Q148W8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Dusp27Q148W8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Dusp27Q148W8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Dusp27Q148W8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Dusp27Q148W8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Dusp27Q148W8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Dusp27Q148W8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Dusp27Q148W8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Dusp27Q148W8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Dusp27Q148W8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Dusp27Q148W8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Dusp27Q148W8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Dusp27Q148W8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Dusp27Q148W8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Dusp27Q148W8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Dusp27Q148W8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Dusp27Q148W8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Dusp27Q148W8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Dusp27Q148W8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Dusp27Q148W8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Dusp27Q148W8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Dusp27Q148W8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Dusp27Q148W8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Dusp27Q148W8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Dusp27Q148W8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Dusp27Q148W8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Dusp27Q148W8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Dusp27Q148W8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Dusp27Q148W8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Dusp27Q148W8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Dusp27Q148W8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Dusp27Q148W8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Dusp27Q148W8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Dusp27Q148W8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Dusp27Q148W8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Dusp27Q148W8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Dusp27Q148W8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Dusp27Q148W8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Dusp27Q148W8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Dusp27Q148W8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Dusp27Q148W8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Dusp27Q148W8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Dusp27Q148W8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Dusp27Q148W8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Dusp27Q148W8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Dusp27Q148W8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Dusp27Q148W8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Dusp27Q148W8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Dusp27Q148W8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Dusp27Q148W8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Dusp27Q148W8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Dusp27Q148W8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Dusp27Q148W8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Dusp27Q148W8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Dusp27Q148W8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Dusp27Q148W8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Dusp27Q148W8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Dusp27Q148W8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Dusp27Q148W8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Dusp27Q148W8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Dusp27Q148W8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Dusp27Q148W8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Dusp27Q148W8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Dusp27Q148W8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Dusp27Q148W8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Dusp27Q148W8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Dusp27Q148W8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Dusp27Q148W8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Dusp27Q148W8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Dusp27Q148W8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Dusp27Q148W8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Dusp27Q148W8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Dusp27Q148W8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Dusp27Q148W8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Dusp27Q148W8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Dusp27Q148W8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Dusp27Q148W8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Dusp27Q148W8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Dusp27Q148W8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Dusp27Q148W8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Dusp27Q148W8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Dusp27Q148W8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Dusp27Q148W8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Dusp27Q148W8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Dusp27Q148W8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Dusp27Q148W8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Dusp27Q148W8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Dusp27Q148W8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Dusp27Q148W8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Dusp27Q148W8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Dusp27Q148W8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Dusp27Q148W8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Dusp27Q148W8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Dusp27Q148W8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Dusp27Q148W8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Dusp27Q148W8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Dusp27Q148W8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Dusp27Q148W8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Dusp27Q148W8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Dusp27Q148W8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms