Protein–RNA interactions for Protein: Q12297

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TAF3Q12297 ACH1YBL015W 1581 nt9.08□□□□□ -0.96
TAF3Q12297 YDL086WYDL086W 822 nt9.08□□□□□ -0.96
TAF3Q12297 SAM2YDR502C 1155 nt9.08□□□□□ -0.96
TAF3Q12297 GID8YMR135C 1368 nt9.08□□□□□ -0.96
TAF3Q12297 HIP1YGR191W 1812 nt9.08□□□□□ -0.96
TAF3Q12297 MET28YIR017C 564 nt9.07□□□□□ -0.96
TAF3Q12297 MEP3YPR138C 1470 nt9.03□□□□□ -0.96
TAF3Q12297 ALP1YNL270C 1722 nt9.02□□□□□ -0.96
TAF3Q12297 PHO89YBR296C 1725 nt9.02□□□□□ -0.96
TAF3Q12297 YMR103CYMR103C 363 nt9.02□□□□□ -0.97
TAF3Q12297 YHR218WYHR218W 1812 nt9.02□□□□□ -0.97
TAF3Q12297 YKL133CYKL133C 1392 nt9.01□□□□□ -0.97
TAF3Q12297 YPS3YLR121C 1527 nt9.01□□□□□ -0.97
TAF3Q12297 MRS6YOR370C 1812 nt9.01□□□□□ -0.97
TAF3Q12297 FLR1YBR008C 1647 nt9.01□□□□□ -0.97
TAF3Q12297 HXK1YFR053C 1458 nt9.01□□□□□ -0.97
TAF3Q12297 NRT1YOR071C 1797 nt8.99□□□□□ -0.97
TAF3Q12297 ALD5YER073W 1563 nt8.99□□□□□ -0.97
TAF3Q12297 SSL2YIL143C 2532 nt8.98□□□□□ -0.97
TAF3Q12297 RSC4YKR008W 1878 nt8.97□□□□□ -0.97
TAF3Q12297 DLD2YDL178W 1593 nt8.95□□□□□ -0.98
TAF3Q12297 SBA1YKL117W 651 nt8.95□□□□□ -0.98
TAF3Q12297 COQ2YNR041C 1119 nt8.95□□□□□ -0.98
TAF3Q12297 YFR018CYFR018C 1092 nt8.94□□□□□ -0.98
TAF3Q12297 MDM35YKL053C-A 261 nt8.94□□□□□ -0.98
TAF3Q12297 FIT3YOR383C 615 nt8.94□□□□□ -0.98
TAF3Q12297 SEC61YLR378C 1443 nt8.94□□□□□ -0.98
TAF3Q12297 HXT10YFL011W 1641 nt8.94□□□□□ -0.98
TAF3Q12297 UTH1YKR042W 1098 nt8.93□□□□□ -0.98
TAF3Q12297 YOR072WYOR072W 315 nt8.93□□□□□ -0.98
TAF3Q12297 UBA4YHR111W 1323 nt8.93□□□□□ -0.98
TAF3Q12297 PHO23YNL097C 993 nt8.91□□□□□ -0.98
TAF3Q12297 CLB6YGR109C 1143 nt8.9□□□□□ -0.98
TAF3Q12297 YHR219WYHR219W 1875 nt8.89□□□□□ -0.99
TAF3Q12297 PCP1YGR101W 1041 nt8.89□□□□□ -0.99
TAF3Q12297 TIM44YIL022W 1296 nt8.89□□□□□ -0.99
TAF3Q12297 OXA1YER154W 1209 nt8.88□□□□□ -0.99
TAF3Q12297 MIR1YJR077C 936 nt8.88□□□□□ -0.99
TAF3Q12297 YSR3YKR053C 1215 nt8.88□□□□□ -0.99
TAF3Q12297 LSR1LSR1 1175 nt8.88□□□□□ -0.99
TAF3Q12297 ADO1YJR105W 1023 nt8.87□□□□□ -0.99
TAF3Q12297 MCM5YLR274W 2328 nt8.86□□□□□ -0.99
TAF3Q12297 HEM13YDR044W 987 nt8.86□□□□□ -0.99
TAF3Q12297 MRPL8YJL063C 717 nt8.86□□□□□ -0.99
TAF3Q12297 CWP2YKL096W-A 279 nt8.86□□□□□ -0.99
TAF3Q12297 AIM1YAL046C 357 nt8.86□□□□□ -0.99
TAF3Q12297 YCR087WYCR087W 516 nt8.85□□□□□ -0.99
TAF3Q12297 RPL4BYDR012W 1089 nt8.85□□□□□ -0.99
TAF3Q12297 RPL4AYBR031W 1089 nt8.85□□□□□ -0.99
TAF3Q12297 YLR046CYLR046C 813 nt8.84□□□□□ -0.99
TAF3Q12297 FRA1YLL029W 2250 nt8.84□□□□□ -0.99
TAF3Q12297 RPD3YNL330C 1302 nt8.83□□□□□ -1
TAF3Q12297 YER188WYER188W 720 nt8.83□□□□□ -1
TAF3Q12297 OSH7YHR001W 1314 nt8.81□□□□□ -1
TAF3Q12297 DLD3YEL071W 1491 nt8.8□□□□□ -1
TAF3Q12297 MSF1YPR047W 1410 nt8.8□□□□□ -1
TAF3Q12297 BNI5YNL166C 1347 nt8.8□□□□□ -1
TAF3Q12297 AGP3YFL055W 1677 nt8.79□□□□□ -1
TAF3Q12297 NBA1YOL070C 1506 nt8.78□□□□□ -1
TAF3Q12297 FUB1YCR076C 753 nt8.77□□□□□ -1.01
TAF3Q12297 RPS14BYJL191W 417 nt8.77□□□□□ -1.01
TAF3Q12297 ENT4YLL038C 744 nt8.77□□□□□ -1.01
TAF3Q12297 XYL2YLR070C 1071 nt8.77□□□□□ -1.01
TAF3Q12297 YMR262WYMR262W 942 nt8.77□□□□□ -1.01
TAF3Q12297 MEX67YPL169C 1800 nt8.77□□□□□ -1.01
TAF3Q12297 THI74YDR438W 1113 nt8.76□□□□□ -1.01
TAF3Q12297 TIP1YBR067C 633 nt8.75□□□□□ -1.01
TAF3Q12297 MSC1YML128C 1542 nt8.75□□□□□ -1.01
TAF3Q12297 RRT5YFR032C 870 nt8.74□□□□□ -1.01
TAF3Q12297 MTO1YGL236C 2010 nt8.73□□□□□ -1.01
TAF3Q12297 TAT2YOL020W 1779 nt8.72□□□□□ -1.01
TAF3Q12297 AIM45YPR004C 1035 nt8.72□□□□□ -1.01
TAF3Q12297 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.71□□□□□ -1.02
TAF3Q12297 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.71□□□□□ -1.02
TAF3Q12297 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.71□□□□□ -1.02
TAF3Q12297 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.71□□□□□ -1.02
TAF3Q12297 VMA11YPL234C 495 nt8.71□□□□□ -1.02
TAF3Q12297 ITR2YOL103W 1830 nt8.7□□□□□ -1.02
TAF3Q12297 SOL2YCR073W-A 948 nt8.7□□□□□ -1.02
TAF3Q12297 INH1YDL181W 258 nt8.7□□□□□ -1.02
TAF3Q12297 RAS2YNL098C 969 nt8.7□□□□□ -1.02
TAF3Q12297 RPC31YNL151C 756 nt8.69□□□□□ -1.02
TAF3Q12297 NUC1YJL208C 990 nt8.68□□□□□ -1.02
TAF3Q12297 GPN2YOR262W 1044 nt8.68□□□□□ -1.02
TAF3Q12297 RIM2YBR192W 1134 nt8.68□□□□□ -1.02
TAF3Q12297 MIM1YOL026C 342 nt8.67□□□□□ -1.02
TAF3Q12297 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.66□□□□□ -1.02
TAF3Q12297 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.66□□□□□ -1.02
TAF3Q12297 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.66□□□□□ -1.02
TAF3Q12297 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.66□□□□□ -1.02
TAF3Q12297 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.66□□□□□ -1.02
TAF3Q12297 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.66□□□□□ -1.02
TAF3Q12297 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.66□□□□□ -1.02
TAF3Q12297 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.66□□□□□ -1.02
TAF3Q12297 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.66□□□□□ -1.02
TAF3Q12297 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.66□□□□□ -1.02
TAF3Q12297 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.66□□□□□ -1.02
TAF3Q12297 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.66□□□□□ -1.02
TAF3Q12297 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.66□□□□□ -1.02
TAF3Q12297 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.66□□□□□ -1.02
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