Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.96□□□□□ -0.98
NFI1Q12216 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.96□□□□□ -0.98
NFI1Q12216 XYL2YLR070C 1071 nt8.96□□□□□ -0.98
NFI1Q12216 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.96□□□□□ -0.98
NFI1Q12216 NAT4YMR069W 858 nt8.96□□□□□ -0.98
NFI1Q12216 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.96□□□□□ -0.98
NFI1Q12216 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.96□□□□□ -0.98
NFI1Q12216 DAK2YFL053W 1776 nt8.95□□□□□ -0.98
NFI1Q12216 YCR087WYCR087W 516 nt8.95□□□□□ -0.98
NFI1Q12216 YAR028WYAR028W 705 nt8.95□□□□□ -0.98
NFI1Q12216 MSF1YPR047W 1410 nt8.95□□□□□ -0.98
NFI1Q12216 SHY1YGR112W 1170 nt8.94□□□□□ -0.98
NFI1Q12216 MET28YIR017C 564 nt8.94□□□□□ -0.98
NFI1Q12216 ADE5,7YGL234W 2409 nt8.93□□□□□ -0.98
NFI1Q12216 YBL086CYBL086C 1401 nt8.93□□□□□ -0.98
NFI1Q12216 SED1YDR077W 1017 nt8.92□□□□□ -0.98
NFI1Q12216 LIP1YMR298W 453 nt8.92□□□□□ -0.98
NFI1Q12216 ECM10YEL030W 1935 nt8.92□□□□□ -0.98
NFI1Q12216 FIT1YDR534C 1587 nt8.91□□□□□ -0.98
NFI1Q12216 MTG2YHR168W 1557 nt8.91□□□□□ -0.98
NFI1Q12216 YGL034CYGL034C 366 nt8.91□□□□□ -0.98
NFI1Q12216 UTH1YKR042W 1098 nt8.89□□□□□ -0.99
NFI1Q12216 ARO8YGL202W 1503 nt8.89□□□□□ -0.99
NFI1Q12216 SGA1YIL099W 1650 nt8.88□□□□□ -0.99
NFI1Q12216 RPL4BYDR012W 1089 nt8.88□□□□□ -0.99
NFI1Q12216 RPL4AYBR031W 1089 nt8.88□□□□□ -0.99
NFI1Q12216 AIM45YPR004C 1035 nt8.88□□□□□ -0.99
NFI1Q12216 CLB6YGR109C 1143 nt8.87□□□□□ -0.99
NFI1Q12216 ZTA1YBR046C 1005 nt8.87□□□□□ -0.99
NFI1Q12216 AKR2YOR034C 2250 nt8.86□□□□□ -0.99
NFI1Q12216 RPS14BYJL191W 417 nt8.84□□□□□ -0.99
NFI1Q12216 SAM1YLR180W 1149 nt8.84□□□□□ -0.99
NFI1Q12216 ALP1YNL270C 1722 nt8.84□□□□□ -0.99
NFI1Q12216 KES1YPL145C 1305 nt8.83□□□□□ -1
NFI1Q12216 LEU9YOR108W 1815 nt8.83□□□□□ -1
NFI1Q12216 YPL251WYPL251W 303 nt8.83□□□□□ -1
NFI1Q12216 UFO1YML088W 2007 nt8.83□□□□□ -1
NFI1Q12216 URA6YKL024C 615 nt8.82□□□□□ -1
NFI1Q12216 FIT3YOR383C 615 nt8.82□□□□□ -1
NFI1Q12216 BRR1YPR057W 1026 nt8.82□□□□□ -1
NFI1Q12216 TOA2YKL058W 369 nt8.81□□□□□ -1
NFI1Q12216 MET30YIL046W 1923 nt8.81□□□□□ -1
NFI1Q12216 ZAP1YJL056C 2643 nt8.8□□□□□ -1
NFI1Q12216 YNL190WYNL190W 615 nt8.79□□□□□ -1
NFI1Q12216 ADE2YOR128C 1716 nt8.78□□□□□ -1
NFI1Q12216 MAM3YOL060C 2121 nt8.77□□□□□ -1.01
NFI1Q12216 CWC15YDR163W 528 nt8.77□□□□□ -1.01
NFI1Q12216 SBA1YKL117W 651 nt8.77□□□□□ -1.01
NFI1Q12216 GND2YGR256W 1479 nt8.77□□□□□ -1.01
NFI1Q12216 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.76□□□□□ -1.01
NFI1Q12216 OYE3YPL171C 1203 nt8.76□□□□□ -1.01
NFI1Q12216 ODC1YPL134C 933 nt8.75□□□□□ -1.01
NFI1Q12216 LAS17YOR181W 1902 nt8.74□□□□□ -1.01
NFI1Q12216 SNU66YOR308C 1764 nt8.74□□□□□ -1.01
NFI1Q12216 YDR306CYDR306C 1437 nt8.74□□□□□ -1.01
NFI1Q12216 QDR2YIL121W 1629 nt8.74□□□□□ -1.01
NFI1Q12216 YMR103CYMR103C 363 nt8.74□□□□□ -1.01
NFI1Q12216 BET2YPR176C 978 nt8.74□□□□□ -1.01
NFI1Q12216 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.73□□□□□ -1.01
NFI1Q12216 PET8YNL003C 855 nt8.73□□□□□ -1.01
NFI1Q12216 OPI10YOL032W 741 nt8.72□□□□□ -1.01
NFI1Q12216 PMA2YPL036W 2844 nt8.72□□□□□ -1.01
NFI1Q12216 NBA1YOL070C 1506 nt8.71□□□□□ -1.01
NFI1Q12216 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt8.71□□□□□ -1.02
NFI1Q12216 HXT10YFL011W 1641 nt8.71□□□□□ -1.02
NFI1Q12216 NDE1YMR145C 1683 nt8.71□□□□□ -1.02
NFI1Q12216 TSC10YBR265W 963 nt8.7□□□□□ -1.02
NFI1Q12216 FRT1YOR324C 1809 nt8.69□□□□□ -1.02
NFI1Q12216 YLR279WYLR279W 390 nt8.68□□□□□ -1.02
NFI1Q12216 CCT2YIL142W 1584 nt8.68□□□□□ -1.02
NFI1Q12216 FMS1YMR020W 1527 nt8.66□□□□□ -1.02
NFI1Q12216 MSB4YOL112W 1479 nt8.66□□□□□ -1.02
NFI1Q12216 SAM2YDR502C 1155 nt8.66□□□□□ -1.02
NFI1Q12216 SDH5YOL071W 489 nt8.66□□□□□ -1.02
NFI1Q12216 SPP2YOR148C 558 nt8.66□□□□□ -1.02
NFI1Q12216 MIM1YOL026C 342 nt8.65□□□□□ -1.02
NFI1Q12216 CCR4YAL021C 2514 nt8.65□□□□□ -1.02
NFI1Q12216 FLR1YBR008C 1647 nt8.65□□□□□ -1.03
NFI1Q12216 YGR012WYGR012W 1182 nt8.64□□□□□ -1.03
NFI1Q12216 Q0010Q0010 387 nt8.64□□□□□ -1.03
NFI1Q12216 ACH1YBL015W 1581 nt8.64□□□□□ -1.03
NFI1Q12216 DUS3YLR401C 2007 nt8.63□□□□□ -1.03
NFI1Q12216 GNP1YDR508C 1992 nt8.62□□□□□ -1.03
NFI1Q12216 LSB6YJL100W 1824 nt8.61□□□□□ -1.03
NFI1Q12216 YPS3YLR121C 1527 nt8.61□□□□□ -1.03
NFI1Q12216 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.61□□□□□ -1.03
NFI1Q12216 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.61□□□□□ -1.03
NFI1Q12216 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.61□□□□□ -1.03
NFI1Q12216 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.61□□□□□ -1.03
NFI1Q12216 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.61□□□□□ -1.03
NFI1Q12216 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.61□□□□□ -1.03
NFI1Q12216 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.61□□□□□ -1.03
NFI1Q12216 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.61□□□□□ -1.03
NFI1Q12216 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.61□□□□□ -1.03
NFI1Q12216 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.61□□□□□ -1.03
NFI1Q12216 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.61□□□□□ -1.03
NFI1Q12216 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.61□□□□□ -1.03
NFI1Q12216 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.61□□□□□ -1.03
NFI1Q12216 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.61□□□□□ -1.03
NFI1Q12216 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.61□□□□□ -1.03
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