Protein–RNA interactions for Protein: Q12080

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP53Q12080 GPN2YOR262W 1044 nt12□□□□□ -0.49
NOP53Q12080 GND1YHR183W 1470 nt12□□□□□ -0.49
NOP53Q12080 RTN2YDL204W 1182 nt11.98□□□□□ -0.49
NOP53Q12080 AAC1YMR056C 930 nt11.98□□□□□ -0.49
NOP53Q12080 PLB1YMR008C 1995 nt11.98□□□□□ -0.49
NOP53Q12080 HEL2YDR266C 1920 nt11.98□□□□□ -0.49
NOP53Q12080 NEM1YHR004C 1341 nt11.97□□□□□ -0.49
NOP53Q12080 Q0255Q0255 1419 nt11.96□□□□□ -0.49
NOP53Q12080 AIR1YIL079C 1083 nt11.96□□□□□ -0.49
NOP53Q12080 MOD5YOR274W 1287 nt11.96□□□□□ -0.49
NOP53Q12080 YEL008WYEL008W 381 nt11.95□□□□□ -0.5
NOP53Q12080 FUR4YBR021W 1902 nt11.95□□□□□ -0.5
NOP53Q12080 ZTA1YBR046C 1005 nt11.93□□□□□ -0.5
NOP53Q12080 KTR3YBR205W 1215 nt11.93□□□□□ -0.5
NOP53Q12080 APT2YDR441C 546 nt11.92□□□□□ -0.5
NOP53Q12080 REC114YMR133W 1287 nt11.92□□□□□ -0.5
NOP53Q12080 YHP1YDR451C 1062 nt11.91□□□□□ -0.5
NOP53Q12080 ATP6Q0085 780 nt11.91□□□□□ -0.5
NOP53Q12080 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt11.91□□□□□ -0.5
NOP53Q12080 YAR028WYAR028W 705 nt11.91□□□□□ -0.5
NOP53Q12080 DIF1YLR437C 402 nt11.91□□□□□ -0.5
NOP53Q12080 ALP1YNL270C 1722 nt11.91□□□□□ -0.5
NOP53Q12080 CPD1YGR247W 720 nt11.9□□□□□ -0.5
NOP53Q12080 AKR2YOR034C 2250 nt11.89□□□□□ -0.51
NOP53Q12080 PIC2YER053C 903 nt11.89□□□□□ -0.51
NOP53Q12080 STD1YOR047C 1335 nt11.88□□□□□ -0.51
NOP53Q12080 SMM1YNR015W 1155 nt11.88□□□□□ -0.51
NOP53Q12080 MTG2YHR168W 1557 nt11.88□□□□□ -0.51
NOP53Q12080 AST1YBL069W 1290 nt11.85□□□□□ -0.51
NOP53Q12080 YBL081WYBL081W 1107 nt11.85□□□□□ -0.51
NOP53Q12080 YGL118CYGL118C 438 nt11.84□□□□□ -0.51
NOP53Q12080 ESS1YJR017C 513 nt11.84□□□□□ -0.51
NOP53Q12080 UTR1YJR049C 1593 nt11.84□□□□□ -0.51
NOP53Q12080 YGL188CYGL188C 174 nt11.83□□□□□ -0.52
NOP53Q12080 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt11.83□□□□□ -0.52
NOP53Q12080 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt11.83□□□□□ -0.52
NOP53Q12080 LSB3YFR024C-A 1380 nt11.8□□□□□ -0.52
NOP53Q12080 CYT2YKL087C 675 nt11.8□□□□□ -0.52
NOP53Q12080 FCY21YER060W 1587 nt11.79□□□□□ -0.52
NOP53Q12080 RIB2YOL066C 1776 nt11.79□□□□□ -0.52
NOP53Q12080 PBP1YGR178C 2169 nt11.78□□□□□ -0.52
NOP53Q12080 YLR036CYLR036C 612 nt11.78□□□□□ -0.52
NOP53Q12080 YML079WYML079W 606 nt11.78□□□□□ -0.52
NOP53Q12080 FRE6YLL051C 2139 nt11.78□□□□□ -0.52
NOP53Q12080 YGR259CYGR259C 441 nt11.77□□□□□ -0.53
NOP53Q12080 PUS5YLR165C 765 nt11.77□□□□□ -0.53
NOP53Q12080 HOS2YGL194C 1359 nt11.77□□□□□ -0.53
NOP53Q12080 MET2YNL277W 1461 nt11.76□□□□□ -0.53
NOP53Q12080 MPC1YGL080W 393 nt11.76□□□□□ -0.53
NOP53Q12080 YKR005CYKR005C 1578 nt11.75□□□□□ -0.53
NOP53Q12080 AIM41YOR215C 558 nt11.75□□□□□ -0.53
NOP53Q12080 BNA3YJL060W 1335 nt11.75□□□□□ -0.53
NOP53Q12080 BIO5YNR056C 1686 nt11.75□□□□□ -0.53
NOP53Q12080 RDN25-1RDN25-1 3396 nt11.75□□□□□ -0.53
NOP53Q12080 RDN25-2RDN25-2 3396 nt11.75□□□□□ -0.53
NOP53Q12080 YOR169CYOR169C 465 nt11.74□□□□□ -0.53
NOP53Q12080 ATG17YLR423C 1254 nt11.73□□□□□ -0.53
NOP53Q12080 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt11.72□□□□□ -0.53
NOP53Q12080 NAT5YOR253W 531 nt11.72□□□□□ -0.53
NOP53Q12080 MRPL36YBR122C 534 nt11.72□□□□□ -0.53
NOP53Q12080 PRY1YJL079C 900 nt11.71□□□□□ -0.53
NOP53Q12080 APM1YPL259C 1428 nt11.69□□□□□ -0.54
NOP53Q12080 UGA4YDL210W 1716 nt11.69□□□□□ -0.54
NOP53Q12080 HXT12YIL170W 1374 nt11.69□□□□□ -0.54
NOP53Q12080 PRP4YPR178W 1398 nt11.69□□□□□ -0.54
NOP53Q12080 YER190C-AYER190C-A 576 nt11.69□□□□□ -0.54
NOP53Q12080 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt11.69□□□□□ -0.54
NOP53Q12080 UBC12YLR306W 567 nt11.69□□□□□ -0.54
NOP53Q12080 YML133W-AYML133W-A 576 nt11.69□□□□□ -0.54
NOP53Q12080 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt11.69□□□□□ -0.54
NOP53Q12080 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt11.69□□□□□ -0.54
NOP53Q12080 ICE2YIL090W 1476 nt11.69□□□□□ -0.54
NOP53Q12080 YAT1YAR035W 2064 nt11.68□□□□□ -0.54
NOP53Q12080 FAF1YIL019W 1041 nt11.68□□□□□ -0.54
NOP53Q12080 VRG4YGL225W 1014 nt11.67□□□□□ -0.54
NOP53Q12080 Q0017Q0017 162 nt11.67□□□□□ -0.54
NOP53Q12080 SED1YDR077W 1017 nt11.66□□□□□ -0.54
NOP53Q12080 ARC19YKL013C 516 nt11.66□□□□□ -0.54
NOP53Q12080 PEX27YOR193W 1131 nt11.66□□□□□ -0.54
NOP53Q12080 SFP1YLR403W 2052 nt11.66□□□□□ -0.54
NOP53Q12080 FHN1YGR131W 525 nt11.65□□□□□ -0.54
NOP53Q12080 SAM35YHR083W 990 nt11.65□□□□□ -0.54
NOP53Q12080 SEN2YLR105C 1134 nt11.65□□□□□ -0.54
NOP53Q12080 PRM5YIL117C 957 nt11.64□□□□□ -0.55
NOP53Q12080 YMR147WYMR147W 672 nt11.64□□□□□ -0.55
NOP53Q12080 YNL234WYNL234W 1281 nt11.64□□□□□ -0.55
NOP53Q12080 DPS1YLL018C 1674 nt11.64□□□□□ -0.55
NOP53Q12080 YJL055WYJL055W 738 nt11.63□□□□□ -0.55
NOP53Q12080 SWP1YMR149W 861 nt11.63□□□□□ -0.55
NOP53Q12080 BMT6YLR063W 1098 nt11.61□□□□□ -0.55
NOP53Q12080 ALD4YOR374W 1560 nt11.61□□□□□ -0.55
NOP53Q12080 PCL10YGL134W 1302 nt11.6□□□□□ -0.55
NOP53Q12080 NAP1YKR048C 1254 nt11.6□□□□□ -0.55
NOP53Q12080 PGC1YPL206C 966 nt11.6□□□□□ -0.55
NOP53Q12080 PAU5YFL020C 369 nt11.59□□□□□ -0.55
NOP53Q12080 LIP1YMR298W 453 nt11.59□□□□□ -0.55
NOP53Q12080 PUP1YOR157C 786 nt11.59□□□□□ -0.55
NOP53Q12080 SCO2YBR024W 906 nt11.59□□□□□ -0.55
NOP53Q12080 NDJ1YOL104C 1059 nt11.58□□□□□ -0.56
NOP53Q12080 GET2YER083C 858 nt11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.6 ms