Protein–RNA interactions for Protein: Q07887

LDB18, Protein LDB18, yeastyeast

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB18Q07887 RIB2YOL066C 1776 nt9.3□□□□□ -0.92
LDB18Q07887 CSM1YCR086W 573 nt9.3□□□□□ -0.92
LDB18Q07887 OXA1YER154W 1209 nt9.29□□□□□ -0.92
LDB18Q07887 PHO23YNL097C 993 nt9.29□□□□□ -0.92
LDB18Q07887 LSB5YCL034W 1065 nt9.29□□□□□ -0.92
LDB18Q07887 NUC1YJL208C 990 nt9.28□□□□□ -0.92
LDB18Q07887 BNI5YNL166C 1347 nt9.28□□□□□ -0.92
LDB18Q07887 YJL055WYJL055W 738 nt9.26□□□□□ -0.93
LDB18Q07887 STE4YOR212W 1272 nt9.26□□□□□ -0.93
LDB18Q07887 MSC1YML128C 1542 nt9.26□□□□□ -0.93
LDB18Q07887 YEL008WYEL008W 381 nt9.23□□□□□ -0.93
LDB18Q07887 RPT5YOR117W 1305 nt9.23□□□□□ -0.93
LDB18Q07887 INA1YLR413W 2028 nt9.21□□□□□ -0.93
LDB18Q07887 YER188WYER188W 720 nt9.21□□□□□ -0.94
LDB18Q07887 YJL118WYJL118W 660 nt9.21□□□□□ -0.94
LDB18Q07887 CWC15YDR163W 528 nt9.2□□□□□ -0.94
LDB18Q07887 YAT1YAR035W 2064 nt9.2□□□□□ -0.94
LDB18Q07887 YLR349WYLR349W 507 nt9.19□□□□□ -0.94
LDB18Q07887 FUB1YCR076C 753 nt9.18□□□□□ -0.94
LDB18Q07887 DLD2YDL178W 1593 nt9.18□□□□□ -0.94
LDB18Q07887 RIB7YBR153W 735 nt9.18□□□□□ -0.94
LDB18Q07887 RSC8YFR037C 1674 nt9.17□□□□□ -0.94
LDB18Q07887 RAS2YNL098C 969 nt9.17□□□□□ -0.94
LDB18Q07887 SAM3YPL274W 1764 nt9.17□□□□□ -0.94
LDB18Q07887 FLR1YBR008C 1647 nt9.16□□□□□ -0.94
LDB18Q07887 FMS1YMR020W 1527 nt9.15□□□□□ -0.94
LDB18Q07887 RAD51YER095W 1203 nt9.15□□□□□ -0.94
LDB18Q07887 YPS3YLR121C 1527 nt9.15□□□□□ -0.95
LDB18Q07887 SPP2YOR148C 558 nt9.14□□□□□ -0.95
LDB18Q07887 GAL3YDR009W 1563 nt9.14□□□□□ -0.95
LDB18Q07887 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.14□□□□□ -0.95
LDB18Q07887 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.14□□□□□ -0.95
LDB18Q07887 OYE2YHR179W 1203 nt9.13□□□□□ -0.95
LDB18Q07887 OSH7YHR001W 1314 nt9.12□□□□□ -0.95
LDB18Q07887 CCT5YJR064W 1689 nt9.11□□□□□ -0.95
LDB18Q07887 ADH7YCR105W 1086 nt9.11□□□□□ -0.95
LDB18Q07887 CPD1YGR247W 720 nt9.1□□□□□ -0.95
LDB18Q07887 GPN2YOR262W 1044 nt9.1□□□□□ -0.95
LDB18Q07887 RPC82YPR190C 1965 nt9.1□□□□□ -0.95
LDB18Q07887 TPS1YBR126C 1488 nt9.09□□□□□ -0.95
LDB18Q07887 VPS62YGR141W 1404 nt9.09□□□□□ -0.95
LDB18Q07887 EAF3YPR023C 1206 nt9.09□□□□□ -0.95
LDB18Q07887 PAU15YIR041W 375 nt9.08□□□□□ -0.96
LDB18Q07887 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.07□□□□□ -0.96
LDB18Q07887 ACH1YBL015W 1581 nt9.06□□□□□ -0.96
LDB18Q07887 HEM13YDR044W 987 nt9.05□□□□□ -0.96
LDB18Q07887 SPT20YOL148C 1815 nt9.05□□□□□ -0.96
LDB18Q07887 SOL2YCR073W-A 948 nt9.03□□□□□ -0.96
LDB18Q07887 YDL086WYDL086W 822 nt9.03□□□□□ -0.96
LDB18Q07887 THI72YOR192C 1800 nt9.02□□□□□ -0.97
LDB18Q07887 ILV3YJR016C 1758 nt9□□□□□ -0.97
LDB18Q07887 TAF13YML098W 504 nt9□□□□□ -0.97
LDB18Q07887 LSM5YER146W 282 nt8.99□□□□□ -0.97
LDB18Q07887 TMA23YMR269W 636 nt8.99□□□□□ -0.97
LDB18Q07887 DAK2YFL053W 1776 nt8.99□□□□□ -0.97
LDB18Q07887 CMP2YML057W 1815 nt8.98□□□□□ -0.97
LDB18Q07887 SNZ1YMR096W 894 nt8.98□□□□□ -0.97
LDB18Q07887 DDI1YER143W 1287 nt8.97□□□□□ -0.97
LDB18Q07887 OPI10YOL032W 741 nt8.97□□□□□ -0.97
LDB18Q07887 YPR126CYPR126C 309 nt8.97□□□□□ -0.97
LDB18Q07887 CCT2YIL142W 1584 nt8.97□□□□□ -0.97
LDB18Q07887 HSL7YBR133C 2484 nt8.96□□□□□ -0.97
LDB18Q07887 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.96□□□□□ -0.98
LDB18Q07887 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.96□□□□□ -0.98
LDB18Q07887 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.96□□□□□ -0.98
LDB18Q07887 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.96□□□□□ -0.98
LDB18Q07887 YNL024CYNL024C 741 nt8.96□□□□□ -0.98
LDB18Q07887 YOR325WYOR325W 474 nt8.96□□□□□ -0.98
LDB18Q07887 TAT2YOL020W 1779 nt8.96□□□□□ -0.98
LDB18Q07887 IML3YBR107C 738 nt8.95□□□□□ -0.98
LDB18Q07887 IMO32YGR031W 1029 nt8.94□□□□□ -0.98
LDB18Q07887 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt8.94□□□□□ -0.98
LDB18Q07887 MHF1YOL086W-A 273 nt8.94□□□□□ -0.98
LDB18Q07887 ESS1YJR017C 513 nt8.93□□□□□ -0.98
LDB18Q07887 CTI6YPL181W 1521 nt8.92□□□□□ -0.98
LDB18Q07887 YDR455CYDR455C 309 nt8.91□□□□□ -0.98
LDB18Q07887 RRT8YOL048C 1029 nt8.9□□□□□ -0.98
LDB18Q07887 MUP1YGR055W 1725 nt8.89□□□□□ -0.99
LDB18Q07887 POT1YIL160C 1254 nt8.89□□□□□ -0.99
LDB18Q07887 AIM1YAL046C 357 nt8.88□□□□□ -0.99
LDB18Q07887 YMR262WYMR262W 942 nt8.88□□□□□ -0.99
LDB18Q07887 ERG13YML126C 1476 nt8.88□□□□□ -0.99
LDB18Q07887 PAU5YFL020C 369 nt8.87□□□□□ -0.99
LDB18Q07887 Q0182Q0182 405 nt8.87□□□□□ -0.99
LDB18Q07887 ENT4YLL038C 744 nt8.87□□□□□ -0.99
LDB18Q07887 HEL2YDR266C 1920 nt8.86□□□□□ -0.99
LDB18Q07887 DIG1YPL049C 1359 nt8.86□□□□□ -0.99
LDB18Q07887 ADE8YDR408C 645 nt8.85□□□□□ -0.99
LDB18Q07887 STP3YLR375W 1032 nt8.85□□□□□ -0.99
LDB18Q07887 GSF2YML048W 1212 nt8.85□□□□□ -0.99
LDB18Q07887 SPS100YHR139C 981 nt8.84□□□□□ -0.99
LDB18Q07887 PGC1YPL206C 966 nt8.84□□□□□ -0.99
LDB18Q07887 BET2YPR176C 978 nt8.84□□□□□ -0.99
LDB18Q07887 LSB6YJL100W 1824 nt8.84□□□□□ -0.99
LDB18Q07887 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8.82□□□□□ -1
LDB18Q07887 MET2YNL277W 1461 nt8.82□□□□□ -1
LDB18Q07887 GID7YCL039W 2238 nt8.81□□□□□ -1
LDB18Q07887 QDR2YIL121W 1629 nt8.81□□□□□ -1
LDB18Q07887 YJR114WYJR114W 393 nt8.81□□□□□ -1
LDB18Q07887 YLR046CYLR046C 813 nt8.81□□□□□ -1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.8 ms