Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Serpina1cQ00896 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Serpina1cQ00896 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Serpina1cQ00896 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Serpina1cQ00896 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Serpina1cQ00896 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Serpina1cQ00896 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Serpina1cQ00896 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Serpina1cQ00896 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Serpina1cQ00896 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Serpina1cQ00896 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Serpina1cQ00896 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Serpina1cQ00896 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Serpina1cQ00896 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Serpina1cQ00896 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Serpina1cQ00896 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Serpina1cQ00896 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Serpina1cQ00896 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Serpina1cQ00896 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Serpina1cQ00896 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Serpina1cQ00896 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Serpina1cQ00896 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Serpina1cQ00896 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Serpina1cQ00896 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Serpina1cQ00896 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Serpina1cQ00896 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Serpina1cQ00896 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Serpina1cQ00896 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Serpina1cQ00896 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Serpina1cQ00896 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Serpina1cQ00896 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Serpina1cQ00896 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Serpina1cQ00896 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Serpina1cQ00896 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Serpina1cQ00896 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Serpina1cQ00896 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Serpina1cQ00896 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Serpina1cQ00896 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Serpina1cQ00896 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Serpina1cQ00896 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Serpina1cQ00896 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Serpina1cQ00896 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Serpina1cQ00896 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Serpina1cQ00896 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Serpina1cQ00896 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Serpina1cQ00896 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Serpina1cQ00896 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Serpina1cQ00896 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Serpina1cQ00896 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Serpina1cQ00896 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Serpina1cQ00896 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Serpina1cQ00896 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Serpina1cQ00896 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Serpina1cQ00896 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Serpina1cQ00896 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Serpina1cQ00896 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Serpina1cQ00896 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Serpina1cQ00896 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Serpina1cQ00896 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Serpina1cQ00896 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Serpina1cQ00896 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Serpina1cQ00896 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Serpina1cQ00896 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Serpina1cQ00896 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Serpina1cQ00896 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Serpina1cQ00896 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Serpina1cQ00896 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Serpina1cQ00896 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Serpina1cQ00896 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Serpina1cQ00896 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Serpina1cQ00896 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Serpina1cQ00896 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Serpina1cQ00896 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Serpina1cQ00896 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Serpina1cQ00896 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Serpina1cQ00896 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Serpina1cQ00896 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Serpina1cQ00896 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Serpina1cQ00896 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Serpina1cQ00896 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Serpina1cQ00896 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Serpina1cQ00896 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Serpina1cQ00896 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Serpina1cQ00896 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Serpina1cQ00896 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Serpina1cQ00896 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Serpina1cQ00896 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Serpina1cQ00896 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Serpina1cQ00896 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Serpina1cQ00896 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Serpina1cQ00896 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Serpina1cQ00896 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Serpina1cQ00896 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Serpina1cQ00896 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Serpina1cQ00896 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Serpina1cQ00896 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Serpina1cQ00896 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Serpina1cQ00896 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Serpina1cQ00896 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Serpina1cQ00896 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms