Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Itga4Q00651 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Itga4Q00651 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Itga4Q00651 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Itga4Q00651 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Itga4Q00651 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Itga4Q00651 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Itga4Q00651 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Itga4Q00651 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itga4Q00651 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itga4Q00651 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itga4Q00651 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itga4Q00651 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itga4Q00651 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itga4Q00651 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itga4Q00651 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Itga4Q00651 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Itga4Q00651 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itga4Q00651 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itga4Q00651 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Itga4Q00651 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Itga4Q00651 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Itga4Q00651 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Itga4Q00651 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itga4Q00651 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itga4Q00651 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itga4Q00651 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itga4Q00651 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itga4Q00651 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Itga4Q00651 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itga4Q00651 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itga4Q00651 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Itga4Q00651 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Itga4Q00651 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Itga4Q00651 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Itga4Q00651 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Itga4Q00651 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Itga4Q00651 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Itga4Q00651 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itga4Q00651 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itga4Q00651 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Itga4Q00651 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Itga4Q00651 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itga4Q00651 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itga4Q00651 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Itga4Q00651 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Itga4Q00651 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Itga4Q00651 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Itga4Q00651 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Itga4Q00651 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Itga4Q00651 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Itga4Q00651 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Itga4Q00651 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Itga4Q00651 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Itga4Q00651 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Itga4Q00651 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Itga4Q00651 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Itga4Q00651 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Itga4Q00651 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Itga4Q00651 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Itga4Q00651 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itga4Q00651 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itga4Q00651 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itga4Q00651 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Itga4Q00651 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Itga4Q00651 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Itga4Q00651 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Itga4Q00651 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Itga4Q00651 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Itga4Q00651 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Itga4Q00651 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Itga4Q00651 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Itga4Q00651 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Itga4Q00651 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Itga4Q00651 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Itga4Q00651 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Itga4Q00651 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Itga4Q00651 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itga4Q00651 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itga4Q00651 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itga4Q00651 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Itga4Q00651 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Itga4Q00651 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Itga4Q00651 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Itga4Q00651 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Itga4Q00651 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itga4Q00651 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itga4Q00651 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Itga4Q00651 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Itga4Q00651 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Itga4Q00651 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Itga4Q00651 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Itga4Q00651 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Itga4Q00651 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itga4Q00651 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itga4Q00651 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Itga4Q00651 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Itga4Q00651 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Itga4Q00651 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Itga4Q00651 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms