Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
Itga4Q00651 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Itga4Q00651 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Itga4Q00651 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Itga4Q00651 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Itga4Q00651 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Itga4Q00651 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Itga4Q00651 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Itga4Q00651 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Itga4Q00651 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Itga4Q00651 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Itga4Q00651 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Itga4Q00651 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Itga4Q00651 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Itga4Q00651 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Itga4Q00651 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Itga4Q00651 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Itga4Q00651 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Itga4Q00651 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Itga4Q00651 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Itga4Q00651 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Itga4Q00651 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Itga4Q00651 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Itga4Q00651 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Itga4Q00651 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Itga4Q00651 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Itga4Q00651 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Itga4Q00651 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Itga4Q00651 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Itga4Q00651 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Itga4Q00651 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Itga4Q00651 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Itga4Q00651 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Itga4Q00651 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Itga4Q00651 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Itga4Q00651 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Itga4Q00651 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Itga4Q00651 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Itga4Q00651 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Itga4Q00651 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Itga4Q00651 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Itga4Q00651 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Itga4Q00651 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Itga4Q00651 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Itga4Q00651 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Itga4Q00651 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Itga4Q00651 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Itga4Q00651 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Itga4Q00651 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Itga4Q00651 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Itga4Q00651 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Itga4Q00651 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Itga4Q00651 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Itga4Q00651 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Itga4Q00651 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Itga4Q00651 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Itga4Q00651 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Itga4Q00651 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Itga4Q00651 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Itga4Q00651 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Itga4Q00651 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Itga4Q00651 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Itga4Q00651 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Itga4Q00651 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Itga4Q00651 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Itga4Q00651 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Itga4Q00651 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Itga4Q00651 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Itga4Q00651 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Itga4Q00651 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Itga4Q00651 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Itga4Q00651 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Itga4Q00651 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Itga4Q00651 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Itga4Q00651 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Itga4Q00651 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Itga4Q00651 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Itga4Q00651 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Itga4Q00651 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Itga4Q00651 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Itga4Q00651 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Itga4Q00651 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Itga4Q00651 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Itga4Q00651 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Itga4Q00651 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Itga4Q00651 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Itga4Q00651 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Itga4Q00651 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Itga4Q00651 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Itga4Q00651 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Itga4Q00651 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Itga4Q00651 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Itga4Q00651 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Itga4Q00651 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Itga4Q00651 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Itga4Q00651 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Itga4Q00651 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Itga4Q00651 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Itga4Q00651 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Itga4Q00651 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms