Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Arf1P84078 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arf1P84078 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arf1P84078 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arf1P84078 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arf1P84078 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arf1P84078 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arf1P84078 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arf1P84078 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arf1P84078 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arf1P84078 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arf1P84078 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arf1P84078 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arf1P84078 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arf1P84078 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arf1P84078 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arf1P84078 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arf1P84078 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Arf1P84078 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arf1P84078 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arf1P84078 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arf1P84078 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arf1P84078 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arf1P84078 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arf1P84078 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arf1P84078 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arf1P84078 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arf1P84078 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Arf1P84078 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arf1P84078 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arf1P84078 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arf1P84078 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arf1P84078 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arf1P84078 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arf1P84078 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Arf1P84078 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arf1P84078 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Arf1P84078 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arf1P84078 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arf1P84078 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arf1P84078 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arf1P84078 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arf1P84078 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arf1P84078 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arf1P84078 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arf1P84078 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arf1P84078 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arf1P84078 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arf1P84078 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arf1P84078 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arf1P84078 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arf1P84078 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arf1P84078 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arf1P84078 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arf1P84078 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arf1P84078 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arf1P84078 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arf1P84078 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arf1P84078 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arf1P84078 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Arf1P84078 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arf1P84078 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arf1P84078 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arf1P84078 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arf1P84078 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arf1P84078 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arf1P84078 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Arf1P84078 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Arf1P84078 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arf1P84078 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Arf1P84078 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arf1P84078 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arf1P84078 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Arf1P84078 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arf1P84078 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arf1P84078 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arf1P84078 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arf1P84078 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arf1P84078 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arf1P84078 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arf1P84078 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arf1P84078 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arf1P84078 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms