Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
Nedd4P46935 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nedd4P46935 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nedd4P46935 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Nedd4P46935 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Nedd4P46935 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Nedd4P46935 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Nedd4P46935 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Nedd4P46935 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Nedd4P46935 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Nedd4P46935 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Nedd4P46935 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Nedd4P46935 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Nedd4P46935 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Nedd4P46935 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Nedd4P46935 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Nedd4P46935 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Nedd4P46935 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Nedd4P46935 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Nedd4P46935 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Nedd4P46935 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Nedd4P46935 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Nedd4P46935 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Nedd4P46935 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Nedd4P46935 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Nedd4P46935 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Nedd4P46935 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Nedd4P46935 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Nedd4P46935 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Nedd4P46935 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Nedd4P46935 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Nedd4P46935 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Nedd4P46935 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Nedd4P46935 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Nedd4P46935 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Nedd4P46935 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Nedd4P46935 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Nedd4P46935 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Nedd4P46935 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Nedd4P46935 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Nedd4P46935 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Nedd4P46935 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Nedd4P46935 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Nedd4P46935 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Nedd4P46935 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Nedd4P46935 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Nedd4P46935 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Nedd4P46935 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Nedd4P46935 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Nedd4P46935 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Nedd4P46935 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Nedd4P46935 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Nedd4P46935 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Nedd4P46935 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Nedd4P46935 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Nedd4P46935 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Nedd4P46935 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Nedd4P46935 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Nedd4P46935 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Nedd4P46935 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Nedd4P46935 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Nedd4P46935 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Nedd4P46935 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Nedd4P46935 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Nedd4P46935 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Nedd4P46935 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Nedd4P46935 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Nedd4P46935 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Nedd4P46935 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Nedd4P46935 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Nedd4P46935 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Nedd4P46935 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Nedd4P46935 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Nedd4P46935 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Nedd4P46935 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Nedd4P46935 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Nedd4P46935 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Nedd4P46935 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Nedd4P46935 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nedd4P46935 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Nedd4P46935 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Nedd4P46935 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Nedd4P46935 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Nedd4P46935 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Nedd4P46935 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Nedd4P46935 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Nedd4P46935 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Nedd4P46935 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Nedd4P46935 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Nedd4P46935 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Nedd4P46935 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Nedd4P46935 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Nedd4P46935 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Nedd4P46935 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Nedd4P46935 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Nedd4P46935 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Nedd4P46935 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Nedd4P46935 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Nedd4P46935 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Nedd4P46935 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms