Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Kdm5cP41230 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Kdm5cP41230 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Kdm5cP41230 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
Kdm5cP41230 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Kdm5cP41230 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Kdm5cP41230 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Kdm5cP41230 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Kdm5cP41230 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Kdm5cP41230 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Kdm5cP41230 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Kdm5cP41230 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Kdm5cP41230 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Kdm5cP41230 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Kdm5cP41230 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Kdm5cP41230 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Kdm5cP41230 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Kdm5cP41230 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Kdm5cP41230 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Kdm5cP41230 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
Kdm5cP41230 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Kdm5cP41230 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Kdm5cP41230 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Kdm5cP41230 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Kdm5cP41230 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Kdm5cP41230 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Kdm5cP41230 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Kdm5cP41230 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Kdm5cP41230 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Kdm5cP41230 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Kdm5cP41230 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Kdm5cP41230 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Kdm5cP41230 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
Kdm5cP41230 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Kdm5cP41230 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Kdm5cP41230 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Kdm5cP41230 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Kdm5cP41230 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Kdm5cP41230 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Kdm5cP41230 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Kdm5cP41230 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Kdm5cP41230 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Kdm5cP41230 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Kdm5cP41230 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Kdm5cP41230 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Kdm5cP41230 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Kdm5cP41230 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Kdm5cP41230 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Kdm5cP41230 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Kdm5cP41230 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Kdm5cP41230 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Kdm5cP41230 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Kdm5cP41230 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Kdm5cP41230 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Kdm5cP41230 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Kdm5cP41230 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Kdm5cP41230 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Kdm5cP41230 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Kdm5cP41230 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Kdm5cP41230 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Kdm5cP41230 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Kdm5cP41230 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Kdm5cP41230 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Kdm5cP41230 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
Kdm5cP41230 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Kdm5cP41230 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Kdm5cP41230 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Kdm5cP41230 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Kdm5cP41230 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Kdm5cP41230 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Kdm5cP41230 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Kdm5cP41230 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Kdm5cP41230 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Kdm5cP41230 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Kdm5cP41230 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Kdm5cP41230 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Kdm5cP41230 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Kdm5cP41230 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Kdm5cP41230 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Kdm5cP41230 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms