Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab23P35288 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab23P35288 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab23P35288 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab23P35288 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab23P35288 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab23P35288 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab23P35288 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab23P35288 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab23P35288 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab23P35288 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab23P35288 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab23P35288 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab23P35288 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab23P35288 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab23P35288 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab23P35288 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rab23P35288 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rab23P35288 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rab23P35288 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rab23P35288 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab23P35288 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab23P35288 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rab23P35288 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab23P35288 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab23P35288 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab23P35288 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rab23P35288 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rab23P35288 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rab23P35288 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab23P35288 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab23P35288 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab23P35288 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab23P35288 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rab23P35288 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rab23P35288 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rab23P35288 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rab23P35288 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rab23P35288 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab23P35288 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab23P35288 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab23P35288 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab23P35288 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab23P35288 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rab23P35288 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rab23P35288 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rab23P35288 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rab23P35288 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rab23P35288 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rab23P35288 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rab23P35288 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab23P35288 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab23P35288 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab23P35288 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab23P35288 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab23P35288 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab23P35288 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab23P35288 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab23P35288 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab23P35288 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab23P35288 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab23P35288 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab23P35288 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab23P35288 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab23P35288 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab23P35288 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rab23P35288 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rab23P35288 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rab23P35288 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rab23P35288 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab23P35288 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab23P35288 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab23P35288 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab23P35288 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab23P35288 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab23P35288 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab23P35288 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab23P35288 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab23P35288 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rab23P35288 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab23P35288 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab23P35288 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab23P35288 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab23P35288 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab23P35288 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab23P35288 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab23P35288 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab23P35288 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab23P35288 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab23P35288 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab23P35288 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab23P35288 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab23P35288 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab23P35288 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab23P35288 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab23P35288 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab23P35288 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab23P35288 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab23P35288 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab23P35288 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms