Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
Rab23P35288 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rab23P35288 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rab23P35288 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Rab23P35288 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Rab23P35288 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rab23P35288 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rab23P35288 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rab23P35288 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Rab23P35288 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Rab23P35288 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rab23P35288 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rab23P35288 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Rab23P35288 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rab23P35288 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Rab23P35288 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Rab23P35288 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Rab23P35288 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Rab23P35288 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rab23P35288 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Rab23P35288 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Rab23P35288 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rab23P35288 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rab23P35288 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Rab23P35288 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Rab23P35288 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rab23P35288 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rab23P35288 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rab23P35288 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Rab23P35288 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rab23P35288 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Rab23P35288 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Rab23P35288 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rab23P35288 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Rab23P35288 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rab23P35288 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rab23P35288 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Rab23P35288 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rab23P35288 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rab23P35288 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rab23P35288 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Rab23P35288 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rab23P35288 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rab23P35288 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Rab23P35288 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rab23P35288 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rab23P35288 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rab23P35288 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rab23P35288 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Rab23P35288 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Rab23P35288 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rab23P35288 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rab23P35288 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rab23P35288 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rab23P35288 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Rab23P35288 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Rab23P35288 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rab23P35288 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rab23P35288 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rab23P35288 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rab23P35288 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rab23P35288 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rab23P35288 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rab23P35288 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rab23P35288 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rab23P35288 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rab23P35288 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rab23P35288 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rab23P35288 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rab23P35288 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rab23P35288 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rab23P35288 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rab23P35288 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rab23P35288 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rab23P35288 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rab23P35288 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rab23P35288 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rab23P35288 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rab23P35288 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rab23P35288 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rab23P35288 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rab23P35288 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rab23P35288 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rab23P35288 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Rab23P35288 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rab23P35288 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rab23P35288 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Rab23P35288 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rab23P35288 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rab23P35288 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rab23P35288 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Rab23P35288 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rab23P35288 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rab23P35288 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rab23P35288 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rab23P35288 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rab23P35288 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rab23P35288 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rab23P35288 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rab23P35288 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms