Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxa10P31310 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxa10P31310 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxa10P31310 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa10P31310 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa10P31310 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa10P31310 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa10P31310 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa10P31310 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa10P31310 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa10P31310 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa10P31310 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa10P31310 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa10P31310 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxa10P31310 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxa10P31310 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxa10P31310 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxa10P31310 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxa10P31310 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa10P31310 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa10P31310 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa10P31310 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa10P31310 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa10P31310 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa10P31310 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa10P31310 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa10P31310 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa10P31310 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa10P31310 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa10P31310 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxa10P31310 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa10P31310 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa10P31310 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa10P31310 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa10P31310 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa10P31310 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxa10P31310 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa10P31310 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa10P31310 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa10P31310 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa10P31310 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa10P31310 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa10P31310 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa10P31310 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa10P31310 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxa10P31310 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxa10P31310 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxa10P31310 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa10P31310 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxa10P31310 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa10P31310 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa10P31310 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa10P31310 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxa10P31310 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa10P31310 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa10P31310 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa10P31310 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa10P31310 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa10P31310 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa10P31310 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa10P31310 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa10P31310 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa10P31310 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa10P31310 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxa10P31310 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxa10P31310 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa10P31310 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa10P31310 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa10P31310 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa10P31310 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa10P31310 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa10P31310 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa10P31310 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa10P31310 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa10P31310 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa10P31310 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa10P31310 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa10P31310 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa10P31310 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa10P31310 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa10P31310 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa10P31310 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa10P31310 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa10P31310 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa10P31310 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa10P31310 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa10P31310 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa10P31310 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa10P31310 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa10P31310 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa10P31310 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa10P31310 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa10P31310 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa10P31310 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa10P31310 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa10P31310 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa10P31310 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa10P31310 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa10P31310 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa10P31310 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms