Protein–RNA interactions for Protein: O88575

Slc6a20b, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3B, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20bO88575 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slc6a20bO88575 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slc6a20bO88575 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slc6a20bO88575 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slc6a20bO88575 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slc6a20bO88575 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slc6a20bO88575 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slc6a20bO88575 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slc6a20bO88575 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slc6a20bO88575 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slc6a20bO88575 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slc6a20bO88575 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slc6a20bO88575 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slc6a20bO88575 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slc6a20bO88575 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slc6a20bO88575 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slc6a20bO88575 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slc6a20bO88575 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slc6a20bO88575 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slc6a20bO88575 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slc6a20bO88575 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slc6a20bO88575 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slc6a20bO88575 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Slc6a20bO88575 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slc6a20bO88575 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slc6a20bO88575 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slc6a20bO88575 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slc6a20bO88575 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slc6a20bO88575 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slc6a20bO88575 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slc6a20bO88575 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slc6a20bO88575 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slc6a20bO88575 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slc6a20bO88575 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slc6a20bO88575 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slc6a20bO88575 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slc6a20bO88575 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slc6a20bO88575 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slc6a20bO88575 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Slc6a20bO88575 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slc6a20bO88575 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slc6a20bO88575 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slc6a20bO88575 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slc6a20bO88575 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slc6a20bO88575 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slc6a20bO88575 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Slc6a20bO88575 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slc6a20bO88575 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slc6a20bO88575 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slc6a20bO88575 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slc6a20bO88575 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slc6a20bO88575 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slc6a20bO88575 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slc6a20bO88575 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slc6a20bO88575 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc6a20bO88575 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc6a20bO88575 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Slc6a20bO88575 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Slc6a20bO88575 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slc6a20bO88575 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slc6a20bO88575 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slc6a20bO88575 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc6a20bO88575 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slc6a20bO88575 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Slc6a20bO88575 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slc6a20bO88575 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slc6a20bO88575 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slc6a20bO88575 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slc6a20bO88575 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Slc6a20bO88575 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slc6a20bO88575 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slc6a20bO88575 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slc6a20bO88575 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slc6a20bO88575 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slc6a20bO88575 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slc6a20bO88575 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slc6a20bO88575 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Slc6a20bO88575 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
Slc6a20bO88575 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Slc6a20bO88575 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Slc6a20bO88575 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slc6a20bO88575 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Slc6a20bO88575 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slc6a20bO88575 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Slc6a20bO88575 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Slc6a20bO88575 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slc6a20bO88575 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slc6a20bO88575 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Slc6a20bO88575 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Slc6a20bO88575 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Slc6a20bO88575 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slc6a20bO88575 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slc6a20bO88575 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slc6a20bO88575 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slc6a20bO88575 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slc6a20bO88575 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slc6a20bO88575 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc6a20bO88575 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Slc6a20bO88575 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slc6a20bO88575 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms