Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z3

2310050C09Rik, MCG120169, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310050C09RikG5E8Z3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2310050C09RikG5E8Z3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2310050C09RikG5E8Z3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2310050C09RikG5E8Z3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2310050C09RikG5E8Z3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
2310050C09RikG5E8Z3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
2310050C09RikG5E8Z3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
2310050C09RikG5E8Z3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
2310050C09RikG5E8Z3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
2310050C09RikG5E8Z3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
2310050C09RikG5E8Z3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
2310050C09RikG5E8Z3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
2310050C09RikG5E8Z3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
2310050C09RikG5E8Z3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
2310050C09RikG5E8Z3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
2310050C09RikG5E8Z3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
2310050C09RikG5E8Z3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
2310050C09RikG5E8Z3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
2310050C09RikG5E8Z3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
2310050C09RikG5E8Z3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
2310050C09RikG5E8Z3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2310050C09RikG5E8Z3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
2310050C09RikG5E8Z3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2310050C09RikG5E8Z3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2310050C09RikG5E8Z3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
2310050C09RikG5E8Z3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2310050C09RikG5E8Z3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2310050C09RikG5E8Z3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
2310050C09RikG5E8Z3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
2310050C09RikG5E8Z3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2310050C09RikG5E8Z3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
2310050C09RikG5E8Z3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
2310050C09RikG5E8Z3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
2310050C09RikG5E8Z3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
2310050C09RikG5E8Z3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
2310050C09RikG5E8Z3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
2310050C09RikG5E8Z3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
2310050C09RikG5E8Z3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
2310050C09RikG5E8Z3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
2310050C09RikG5E8Z3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
2310050C09RikG5E8Z3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
2310050C09RikG5E8Z3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
2310050C09RikG5E8Z3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
2310050C09RikG5E8Z3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
2310050C09RikG5E8Z3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
2310050C09RikG5E8Z3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
2310050C09RikG5E8Z3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
2310050C09RikG5E8Z3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
2310050C09RikG5E8Z3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
2310050C09RikG5E8Z3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
2310050C09RikG5E8Z3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
2310050C09RikG5E8Z3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
2310050C09RikG5E8Z3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
2310050C09RikG5E8Z3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
2310050C09RikG5E8Z3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
2310050C09RikG5E8Z3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
2310050C09RikG5E8Z3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
2310050C09RikG5E8Z3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
2310050C09RikG5E8Z3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
2310050C09RikG5E8Z3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
2310050C09RikG5E8Z3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
2310050C09RikG5E8Z3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
2310050C09RikG5E8Z3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
2310050C09RikG5E8Z3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
2310050C09RikG5E8Z3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
2310050C09RikG5E8Z3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
2310050C09RikG5E8Z3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
2310050C09RikG5E8Z3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
2310050C09RikG5E8Z3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
2310050C09RikG5E8Z3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
2310050C09RikG5E8Z3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
2310050C09RikG5E8Z3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
2310050C09RikG5E8Z3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
2310050C09RikG5E8Z3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
2310050C09RikG5E8Z3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
2310050C09RikG5E8Z3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
2310050C09RikG5E8Z3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
2310050C09RikG5E8Z3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
2310050C09RikG5E8Z3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
2310050C09RikG5E8Z3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
2310050C09RikG5E8Z3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
2310050C09RikG5E8Z3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
2310050C09RikG5E8Z3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2310050C09RikG5E8Z3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2310050C09RikG5E8Z3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
2310050C09RikG5E8Z3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
2310050C09RikG5E8Z3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
2310050C09RikG5E8Z3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
2310050C09RikG5E8Z3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
2310050C09RikG5E8Z3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
2310050C09RikG5E8Z3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
2310050C09RikG5E8Z3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
2310050C09RikG5E8Z3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
2310050C09RikG5E8Z3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
2310050C09RikG5E8Z3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
2310050C09RikG5E8Z3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
2310050C09RikG5E8Z3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
2310050C09RikG5E8Z3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
2310050C09RikG5E8Z3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2310050C09RikG5E8Z3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms